Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4W6

AFG3L2, AFG3-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG3L2Q9Y4W6 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AFG3L2Q9Y4W6 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AFG3L2Q9Y4W6 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AFG3L2Q9Y4W6 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AFG3L2Q9Y4W6 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AFG3L2Q9Y4W6 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AFG3L2Q9Y4W6 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AFG3L2Q9Y4W6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AFG3L2Q9Y4W6 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AFG3L2Q9Y4W6 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AFG3L2Q9Y4W6 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AFG3L2Q9Y4W6 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AFG3L2Q9Y4W6 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AFG3L2Q9Y4W6 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
AFG3L2Q9Y4W6 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AFG3L2Q9Y4W6 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AFG3L2Q9Y4W6 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AFG3L2Q9Y4W6 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AFG3L2Q9Y4W6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AFG3L2Q9Y4W6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AFG3L2Q9Y4W6 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AFG3L2Q9Y4W6 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AFG3L2Q9Y4W6 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AFG3L2Q9Y4W6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AFG3L2Q9Y4W6 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AFG3L2Q9Y4W6 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AFG3L2Q9Y4W6 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AFG3L2Q9Y4W6 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AFG3L2Q9Y4W6 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AFG3L2Q9Y4W6 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AFG3L2Q9Y4W6 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AFG3L2Q9Y4W6 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AFG3L2Q9Y4W6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AFG3L2Q9Y4W6 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
AFG3L2Q9Y4W6 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AFG3L2Q9Y4W6 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AFG3L2Q9Y4W6 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AFG3L2Q9Y4W6 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AFG3L2Q9Y4W6 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AFG3L2Q9Y4W6 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AFG3L2Q9Y4W6 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
AFG3L2Q9Y4W6 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AFG3L2Q9Y4W6 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AFG3L2Q9Y4W6 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AFG3L2Q9Y4W6 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AFG3L2Q9Y4W6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AFG3L2Q9Y4W6 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AFG3L2Q9Y4W6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AFG3L2Q9Y4W6 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AFG3L2Q9Y4W6 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AFG3L2Q9Y4W6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AFG3L2Q9Y4W6 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AFG3L2Q9Y4W6 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AFG3L2Q9Y4W6 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AFG3L2Q9Y4W6 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AFG3L2Q9Y4W6 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AFG3L2Q9Y4W6 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AFG3L2Q9Y4W6 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AFG3L2Q9Y4W6 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AFG3L2Q9Y4W6 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AFG3L2Q9Y4W6 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AFG3L2Q9Y4W6 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AFG3L2Q9Y4W6 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AFG3L2Q9Y4W6 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
AFG3L2Q9Y4W6 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
AFG3L2Q9Y4W6 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AFG3L2Q9Y4W6 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
AFG3L2Q9Y4W6 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
AFG3L2Q9Y4W6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
AFG3L2Q9Y4W6 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
AFG3L2Q9Y4W6 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
AFG3L2Q9Y4W6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AFG3L2Q9Y4W6 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
AFG3L2Q9Y4W6 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AFG3L2Q9Y4W6 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AFG3L2Q9Y4W6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
AFG3L2Q9Y4W6 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AFG3L2Q9Y4W6 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
AFG3L2Q9Y4W6 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
AFG3L2Q9Y4W6 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
AFG3L2Q9Y4W6 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
AFG3L2Q9Y4W6 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
AFG3L2Q9Y4W6 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
AFG3L2Q9Y4W6 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
AFG3L2Q9Y4W6 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
AFG3L2Q9Y4W6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AFG3L2Q9Y4W6 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
AFG3L2Q9Y4W6 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AFG3L2Q9Y4W6 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
AFG3L2Q9Y4W6 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
AFG3L2Q9Y4W6 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AFG3L2Q9Y4W6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AFG3L2Q9Y4W6 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AFG3L2Q9Y4W6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AFG3L2Q9Y4W6 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AFG3L2Q9Y4W6 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
AFG3L2Q9Y4W6 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AFG3L2Q9Y4W6 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AFG3L2Q9Y4W6 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
AFG3L2Q9Y4W6 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms