Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3S2

ZNF330, Zinc finger protein 330, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF330Q9Y3S2 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF330Q9Y3S2 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF330Q9Y3S2 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF330Q9Y3S2 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF330Q9Y3S2 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF330Q9Y3S2 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF330Q9Y3S2 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF330Q9Y3S2 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF330Q9Y3S2 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF330Q9Y3S2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
ZNF330Q9Y3S2 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF330Q9Y3S2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF330Q9Y3S2 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF330Q9Y3S2 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF330Q9Y3S2 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF330Q9Y3S2 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF330Q9Y3S2 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF330Q9Y3S2 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF330Q9Y3S2 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF330Q9Y3S2 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF330Q9Y3S2 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF330Q9Y3S2 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF330Q9Y3S2 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF330Q9Y3S2 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF330Q9Y3S2 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF330Q9Y3S2 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF330Q9Y3S2 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF330Q9Y3S2 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF330Q9Y3S2 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF330Q9Y3S2 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF330Q9Y3S2 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF330Q9Y3S2 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF330Q9Y3S2 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF330Q9Y3S2 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF330Q9Y3S2 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF330Q9Y3S2 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF330Q9Y3S2 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF330Q9Y3S2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF330Q9Y3S2 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF330Q9Y3S2 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF330Q9Y3S2 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF330Q9Y3S2 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF330Q9Y3S2 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF330Q9Y3S2 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF330Q9Y3S2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF330Q9Y3S2 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF330Q9Y3S2 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF330Q9Y3S2 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF330Q9Y3S2 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF330Q9Y3S2 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF330Q9Y3S2 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF330Q9Y3S2 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF330Q9Y3S2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF330Q9Y3S2 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF330Q9Y3S2 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF330Q9Y3S2 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF330Q9Y3S2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF330Q9Y3S2 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF330Q9Y3S2 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF330Q9Y3S2 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF330Q9Y3S2 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF330Q9Y3S2 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF330Q9Y3S2 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF330Q9Y3S2 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF330Q9Y3S2 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF330Q9Y3S2 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF330Q9Y3S2 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF330Q9Y3S2 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF330Q9Y3S2 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF330Q9Y3S2 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF330Q9Y3S2 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF330Q9Y3S2 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF330Q9Y3S2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF330Q9Y3S2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF330Q9Y3S2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF330Q9Y3S2 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF330Q9Y3S2 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF330Q9Y3S2 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF330Q9Y3S2 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF330Q9Y3S2 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF330Q9Y3S2 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF330Q9Y3S2 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF330Q9Y3S2 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF330Q9Y3S2 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF330Q9Y3S2 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF330Q9Y3S2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF330Q9Y3S2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF330Q9Y3S2 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF330Q9Y3S2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF330Q9Y3S2 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF330Q9Y3S2 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF330Q9Y3S2 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF330Q9Y3S2 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF330Q9Y3S2 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNF330Q9Y3S2 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNF330Q9Y3S2 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNF330Q9Y3S2 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNF330Q9Y3S2 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNF330Q9Y3S2 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNF330Q9Y3S2 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms