Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q9Y3F1 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q9Y3F1 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q9Y3F1 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q9Y3F1 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q9Y3F1 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q9Y3F1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q9Y3F1 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q9Y3F1 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q9Y3F1 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q9Y3F1 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Q9Y3F1 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q9Y3F1 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q9Y3F1 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q9Y3F1 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q9Y3F1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q9Y3F1 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Q9Y3F1 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Q9Y3F1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Q9Y3F1 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q9Y3F1 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q9Y3F1 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q9Y3F1 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q9Y3F1 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q9Y3F1 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q9Y3F1 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q9Y3F1 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q9Y3F1 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q9Y3F1 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q9Y3F1 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q9Y3F1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q9Y3F1 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q9Y3F1 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q9Y3F1 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Q9Y3F1 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q9Y3F1 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q9Y3F1 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q9Y3F1 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q9Y3F1 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q9Y3F1 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q9Y3F1 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q9Y3F1 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Q9Y3F1 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q9Y3F1 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q9Y3F1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q9Y3F1 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q9Y3F1 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q9Y3F1 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q9Y3F1 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q9Y3F1 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q9Y3F1 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q9Y3F1 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q9Y3F1 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q9Y3F1 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Q9Y3F1 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q9Y3F1 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q9Y3F1 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q9Y3F1 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q9Y3F1 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q9Y3F1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q9Y3F1 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q9Y3F1 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q9Y3F1 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q9Y3F1 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q9Y3F1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q9Y3F1 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q9Y3F1 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Q9Y3F1 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q9Y3F1 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q9Y3F1 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q9Y3F1 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q9Y3F1 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q9Y3F1 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q9Y3F1 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q9Y3F1 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q9Y3F1 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q9Y3F1 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q9Y3F1 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q9Y3F1 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q9Y3F1 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q9Y3F1 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Q9Y3F1 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q9Y3F1 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q9Y3F1 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q9Y3F1 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q9Y3F1 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q9Y3F1 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q9Y3F1 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q9Y3F1 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q9Y3F1 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q9Y3F1 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Q9Y3F1 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q9Y3F1 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q9Y3F1 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q9Y3F1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q9Y3F1 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q9Y3F1 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q9Y3F1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q9Y3F1 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q9Y3F1 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms