Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B2

EXOSC1, Exosome complex component CSL4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC1Q9Y3B2 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EXOSC1Q9Y3B2 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EXOSC1Q9Y3B2 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EXOSC1Q9Y3B2 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EXOSC1Q9Y3B2 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EXOSC1Q9Y3B2 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EXOSC1Q9Y3B2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
EXOSC1Q9Y3B2 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EXOSC1Q9Y3B2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EXOSC1Q9Y3B2 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EXOSC1Q9Y3B2 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
EXOSC1Q9Y3B2 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EXOSC1Q9Y3B2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EXOSC1Q9Y3B2 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
EXOSC1Q9Y3B2 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EXOSC1Q9Y3B2 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EXOSC1Q9Y3B2 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EXOSC1Q9Y3B2 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EXOSC1Q9Y3B2 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EXOSC1Q9Y3B2 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EXOSC1Q9Y3B2 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EXOSC1Q9Y3B2 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EXOSC1Q9Y3B2 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EXOSC1Q9Y3B2 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EXOSC1Q9Y3B2 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EXOSC1Q9Y3B2 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EXOSC1Q9Y3B2 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EXOSC1Q9Y3B2 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EXOSC1Q9Y3B2 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EXOSC1Q9Y3B2 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EXOSC1Q9Y3B2 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EXOSC1Q9Y3B2 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18■□□□□ 0.47
EXOSC1Q9Y3B2 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EXOSC1Q9Y3B2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EXOSC1Q9Y3B2 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EXOSC1Q9Y3B2 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EXOSC1Q9Y3B2 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EXOSC1Q9Y3B2 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EXOSC1Q9Y3B2 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18■□□□□ 0.47
EXOSC1Q9Y3B2 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EXOSC1Q9Y3B2 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EXOSC1Q9Y3B2 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EXOSC1Q9Y3B2 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EXOSC1Q9Y3B2 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EXOSC1Q9Y3B2 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EXOSC1Q9Y3B2 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EXOSC1Q9Y3B2 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EXOSC1Q9Y3B2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
EXOSC1Q9Y3B2 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EXOSC1Q9Y3B2 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EXOSC1Q9Y3B2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EXOSC1Q9Y3B2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
EXOSC1Q9Y3B2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
EXOSC1Q9Y3B2 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EXOSC1Q9Y3B2 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EXOSC1Q9Y3B2 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EXOSC1Q9Y3B2 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EXOSC1Q9Y3B2 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EXOSC1Q9Y3B2 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EXOSC1Q9Y3B2 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EXOSC1Q9Y3B2 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EXOSC1Q9Y3B2 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EXOSC1Q9Y3B2 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EXOSC1Q9Y3B2 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EXOSC1Q9Y3B2 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EXOSC1Q9Y3B2 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EXOSC1Q9Y3B2 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EXOSC1Q9Y3B2 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EXOSC1Q9Y3B2 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EXOSC1Q9Y3B2 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EXOSC1Q9Y3B2 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EXOSC1Q9Y3B2 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EXOSC1Q9Y3B2 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EXOSC1Q9Y3B2 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EXOSC1Q9Y3B2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EXOSC1Q9Y3B2 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
EXOSC1Q9Y3B2 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EXOSC1Q9Y3B2 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EXOSC1Q9Y3B2 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EXOSC1Q9Y3B2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EXOSC1Q9Y3B2 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EXOSC1Q9Y3B2 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
EXOSC1Q9Y3B2 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EXOSC1Q9Y3B2 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EXOSC1Q9Y3B2 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EXOSC1Q9Y3B2 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EXOSC1Q9Y3B2 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EXOSC1Q9Y3B2 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EXOSC1Q9Y3B2 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EXOSC1Q9Y3B2 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EXOSC1Q9Y3B2 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EXOSC1Q9Y3B2 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EXOSC1Q9Y3B2 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EXOSC1Q9Y3B2 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EXOSC1Q9Y3B2 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EXOSC1Q9Y3B2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EXOSC1Q9Y3B2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EXOSC1Q9Y3B2 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EXOSC1Q9Y3B2 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EXOSC1Q9Y3B2 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms