Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SETD1BQ9UPS6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SETD1BQ9UPS6 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SETD1BQ9UPS6 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SETD1BQ9UPS6 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SETD1BQ9UPS6 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SETD1BQ9UPS6 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SETD1BQ9UPS6 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SETD1BQ9UPS6 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SETD1BQ9UPS6 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SETD1BQ9UPS6 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
SETD1BQ9UPS6 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SETD1BQ9UPS6 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SETD1BQ9UPS6 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SETD1BQ9UPS6 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SETD1BQ9UPS6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SETD1BQ9UPS6 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SETD1BQ9UPS6 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SETD1BQ9UPS6 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
SETD1BQ9UPS6 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SETD1BQ9UPS6 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SETD1BQ9UPS6 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SETD1BQ9UPS6 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
SETD1BQ9UPS6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SETD1BQ9UPS6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SETD1BQ9UPS6 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SETD1BQ9UPS6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SETD1BQ9UPS6 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SETD1BQ9UPS6 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SETD1BQ9UPS6 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
SETD1BQ9UPS6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SETD1BQ9UPS6 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SETD1BQ9UPS6 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SETD1BQ9UPS6 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
SETD1BQ9UPS6 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SETD1BQ9UPS6 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SETD1BQ9UPS6 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SETD1BQ9UPS6 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SETD1BQ9UPS6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SETD1BQ9UPS6 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SETD1BQ9UPS6 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SETD1BQ9UPS6 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
SETD1BQ9UPS6 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SETD1BQ9UPS6 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
SETD1BQ9UPS6 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SETD1BQ9UPS6 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SETD1BQ9UPS6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SETD1BQ9UPS6 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SETD1BQ9UPS6 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SETD1BQ9UPS6 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SETD1BQ9UPS6 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SETD1BQ9UPS6 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SETD1BQ9UPS6 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SETD1BQ9UPS6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SETD1BQ9UPS6 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SETD1BQ9UPS6 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
SETD1BQ9UPS6 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SETD1BQ9UPS6 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SETD1BQ9UPS6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SETD1BQ9UPS6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SETD1BQ9UPS6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SETD1BQ9UPS6 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SETD1BQ9UPS6 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SETD1BQ9UPS6 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SETD1BQ9UPS6 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SETD1BQ9UPS6 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SETD1BQ9UPS6 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SETD1BQ9UPS6 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SETD1BQ9UPS6 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
SETD1BQ9UPS6 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SETD1BQ9UPS6 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SETD1BQ9UPS6 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
SETD1BQ9UPS6 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
SETD1BQ9UPS6 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
SETD1BQ9UPS6 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SETD1BQ9UPS6 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SETD1BQ9UPS6 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SETD1BQ9UPS6 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
SETD1BQ9UPS6 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SETD1BQ9UPS6 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
SETD1BQ9UPS6 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SETD1BQ9UPS6 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SETD1BQ9UPS6 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SETD1BQ9UPS6 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SETD1BQ9UPS6 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SETD1BQ9UPS6 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SETD1BQ9UPS6 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SETD1BQ9UPS6 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SETD1BQ9UPS6 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SETD1BQ9UPS6 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SETD1BQ9UPS6 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SETD1BQ9UPS6 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SETD1BQ9UPS6 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SETD1BQ9UPS6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SETD1BQ9UPS6 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SETD1BQ9UPS6 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SETD1BQ9UPS6 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SETD1BQ9UPS6 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SETD1BQ9UPS6 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SETD1BQ9UPS6 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms