Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL4

GJD2, Gap junction delta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD2Q9UKL4 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJD2Q9UKL4 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJD2Q9UKL4 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GJD2Q9UKL4 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJD2Q9UKL4 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJD2Q9UKL4 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GJD2Q9UKL4 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJD2Q9UKL4 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJD2Q9UKL4 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJD2Q9UKL4 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJD2Q9UKL4 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJD2Q9UKL4 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJD2Q9UKL4 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJD2Q9UKL4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJD2Q9UKL4 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJD2Q9UKL4 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJD2Q9UKL4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJD2Q9UKL4 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJD2Q9UKL4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJD2Q9UKL4 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJD2Q9UKL4 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJD2Q9UKL4 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJD2Q9UKL4 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJD2Q9UKL4 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJD2Q9UKL4 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJD2Q9UKL4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJD2Q9UKL4 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GJD2Q9UKL4 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJD2Q9UKL4 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJD2Q9UKL4 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJD2Q9UKL4 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJD2Q9UKL4 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJD2Q9UKL4 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GJD2Q9UKL4 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJD2Q9UKL4 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJD2Q9UKL4 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GJD2Q9UKL4 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJD2Q9UKL4 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJD2Q9UKL4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJD2Q9UKL4 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJD2Q9UKL4 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJD2Q9UKL4 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJD2Q9UKL4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJD2Q9UKL4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GJD2Q9UKL4 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GJD2Q9UKL4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GJD2Q9UKL4 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GJD2Q9UKL4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GJD2Q9UKL4 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GJD2Q9UKL4 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GJD2Q9UKL4 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GJD2Q9UKL4 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GJD2Q9UKL4 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GJD2Q9UKL4 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GJD2Q9UKL4 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GJD2Q9UKL4 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GJD2Q9UKL4 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GJD2Q9UKL4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJD2Q9UKL4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJD2Q9UKL4 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJD2Q9UKL4 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GJD2Q9UKL4 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJD2Q9UKL4 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJD2Q9UKL4 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJD2Q9UKL4 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJD2Q9UKL4 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJD2Q9UKL4 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJD2Q9UKL4 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJD2Q9UKL4 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJD2Q9UKL4 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJD2Q9UKL4 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJD2Q9UKL4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GJD2Q9UKL4 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJD2Q9UKL4 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJD2Q9UKL4 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJD2Q9UKL4 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJD2Q9UKL4 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJD2Q9UKL4 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJD2Q9UKL4 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJD2Q9UKL4 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJD2Q9UKL4 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJD2Q9UKL4 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GJD2Q9UKL4 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJD2Q9UKL4 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJD2Q9UKL4 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJD2Q9UKL4 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GJD2Q9UKL4 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJD2Q9UKL4 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJD2Q9UKL4 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJD2Q9UKL4 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJD2Q9UKL4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GJD2Q9UKL4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJD2Q9UKL4 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJD2Q9UKL4 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJD2Q9UKL4 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJD2Q9UKL4 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJD2Q9UKL4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJD2Q9UKL4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJD2Q9UKL4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJD2Q9UKL4 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms