Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI2

CDC42EP3, Cdc42 effector protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP3Q9UKI2 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms