Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK58

CCNL1, Cyclin-L1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNL1Q9UK58 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CCNL1Q9UK58 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCNL1Q9UK58 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCNL1Q9UK58 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCNL1Q9UK58 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCNL1Q9UK58 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCNL1Q9UK58 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCNL1Q9UK58 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCNL1Q9UK58 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCNL1Q9UK58 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCNL1Q9UK58 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCNL1Q9UK58 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCNL1Q9UK58 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCNL1Q9UK58 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCNL1Q9UK58 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCNL1Q9UK58 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCNL1Q9UK58 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCNL1Q9UK58 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCNL1Q9UK58 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCNL1Q9UK58 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CCNL1Q9UK58 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCNL1Q9UK58 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCNL1Q9UK58 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCNL1Q9UK58 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCNL1Q9UK58 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCNL1Q9UK58 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CCNL1Q9UK58 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCNL1Q9UK58 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCNL1Q9UK58 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCNL1Q9UK58 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCNL1Q9UK58 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCNL1Q9UK58 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCNL1Q9UK58 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCNL1Q9UK58 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCNL1Q9UK58 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCNL1Q9UK58 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCNL1Q9UK58 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCNL1Q9UK58 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCNL1Q9UK58 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCNL1Q9UK58 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCNL1Q9UK58 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCNL1Q9UK58 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCNL1Q9UK58 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCNL1Q9UK58 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCNL1Q9UK58 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCNL1Q9UK58 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCNL1Q9UK58 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCNL1Q9UK58 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCNL1Q9UK58 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCNL1Q9UK58 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCNL1Q9UK58 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CCNL1Q9UK58 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCNL1Q9UK58 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCNL1Q9UK58 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCNL1Q9UK58 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCNL1Q9UK58 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCNL1Q9UK58 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCNL1Q9UK58 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CCNL1Q9UK58 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCNL1Q9UK58 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCNL1Q9UK58 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CCNL1Q9UK58 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCNL1Q9UK58 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCNL1Q9UK58 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCNL1Q9UK58 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCNL1Q9UK58 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CCNL1Q9UK58 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCNL1Q9UK58 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCNL1Q9UK58 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCNL1Q9UK58 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCNL1Q9UK58 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCNL1Q9UK58 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCNL1Q9UK58 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCNL1Q9UK58 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCNL1Q9UK58 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCNL1Q9UK58 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCNL1Q9UK58 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCNL1Q9UK58 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCNL1Q9UK58 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCNL1Q9UK58 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCNL1Q9UK58 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CCNL1Q9UK58 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCNL1Q9UK58 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCNL1Q9UK58 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCNL1Q9UK58 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCNL1Q9UK58 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCNL1Q9UK58 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCNL1Q9UK58 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCNL1Q9UK58 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCNL1Q9UK58 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCNL1Q9UK58 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCNL1Q9UK58 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCNL1Q9UK58 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCNL1Q9UK58 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCNL1Q9UK58 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCNL1Q9UK58 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCNL1Q9UK58 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCNL1Q9UK58 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCNL1Q9UK58 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCNL1Q9UK58 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms