Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBE1Q9UJT0 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBE1Q9UJT0 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBE1Q9UJT0 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBE1Q9UJT0 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBE1Q9UJT0 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBE1Q9UJT0 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBE1Q9UJT0 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBE1Q9UJT0 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBE1Q9UJT0 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBE1Q9UJT0 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBE1Q9UJT0 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBE1Q9UJT0 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBE1Q9UJT0 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBE1Q9UJT0 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBE1Q9UJT0 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBE1Q9UJT0 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBE1Q9UJT0 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBE1Q9UJT0 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBE1Q9UJT0 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBE1Q9UJT0 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBE1Q9UJT0 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBE1Q9UJT0 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBE1Q9UJT0 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBE1Q9UJT0 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBE1Q9UJT0 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBE1Q9UJT0 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBE1Q9UJT0 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBE1Q9UJT0 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBE1Q9UJT0 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBE1Q9UJT0 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBE1Q9UJT0 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBE1Q9UJT0 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBE1Q9UJT0 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBE1Q9UJT0 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBE1Q9UJT0 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBE1Q9UJT0 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBE1Q9UJT0 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBE1Q9UJT0 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBE1Q9UJT0 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBE1Q9UJT0 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBE1Q9UJT0 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBE1Q9UJT0 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBE1Q9UJT0 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBE1Q9UJT0 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBE1Q9UJT0 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBE1Q9UJT0 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBE1Q9UJT0 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBE1Q9UJT0 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBE1Q9UJT0 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBE1Q9UJT0 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBE1Q9UJT0 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBE1Q9UJT0 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBE1Q9UJT0 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBE1Q9UJT0 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBE1Q9UJT0 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBE1Q9UJT0 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBE1Q9UJT0 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBE1Q9UJT0 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBE1Q9UJT0 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBE1Q9UJT0 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBE1Q9UJT0 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBE1Q9UJT0 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBE1Q9UJT0 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBE1Q9UJT0 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBE1Q9UJT0 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBE1Q9UJT0 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBE1Q9UJT0 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBE1Q9UJT0 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBE1Q9UJT0 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBE1Q9UJT0 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBE1Q9UJT0 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBE1Q9UJT0 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBE1Q9UJT0 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBE1Q9UJT0 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBE1Q9UJT0 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBE1Q9UJT0 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBE1Q9UJT0 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBE1Q9UJT0 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBE1Q9UJT0 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBE1Q9UJT0 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBE1Q9UJT0 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBE1Q9UJT0 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBE1Q9UJT0 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBE1Q9UJT0 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBE1Q9UJT0 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBE1Q9UJT0 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
TUBE1Q9UJT0 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23■■□□□ 1.27
TUBE1Q9UJT0 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TUBE1Q9UJT0 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TUBE1Q9UJT0 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TUBE1Q9UJT0 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TUBE1Q9UJT0 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
TUBE1Q9UJT0 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TUBE1Q9UJT0 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TUBE1Q9UJT0 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TUBE1Q9UJT0 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TUBE1Q9UJT0 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TUBE1Q9UJT0 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TUBE1Q9UJT0 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms