Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ99

CDH22, Cadherin-22, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH22Q9UJ99 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH22Q9UJ99 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH22Q9UJ99 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH22Q9UJ99 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH22Q9UJ99 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH22Q9UJ99 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH22Q9UJ99 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH22Q9UJ99 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH22Q9UJ99 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH22Q9UJ99 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH22Q9UJ99 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH22Q9UJ99 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH22Q9UJ99 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH22Q9UJ99 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH22Q9UJ99 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH22Q9UJ99 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH22Q9UJ99 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH22Q9UJ99 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH22Q9UJ99 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH22Q9UJ99 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH22Q9UJ99 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH22Q9UJ99 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH22Q9UJ99 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH22Q9UJ99 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH22Q9UJ99 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH22Q9UJ99 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH22Q9UJ99 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH22Q9UJ99 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH22Q9UJ99 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH22Q9UJ99 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH22Q9UJ99 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH22Q9UJ99 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH22Q9UJ99 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH22Q9UJ99 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH22Q9UJ99 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH22Q9UJ99 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH22Q9UJ99 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH22Q9UJ99 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDH22Q9UJ99 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDH22Q9UJ99 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDH22Q9UJ99 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDH22Q9UJ99 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDH22Q9UJ99 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDH22Q9UJ99 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDH22Q9UJ99 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDH22Q9UJ99 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CDH22Q9UJ99 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDH22Q9UJ99 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDH22Q9UJ99 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDH22Q9UJ99 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH22Q9UJ99 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH22Q9UJ99 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH22Q9UJ99 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH22Q9UJ99 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH22Q9UJ99 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH22Q9UJ99 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH22Q9UJ99 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH22Q9UJ99 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH22Q9UJ99 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH22Q9UJ99 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH22Q9UJ99 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH22Q9UJ99 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH22Q9UJ99 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH22Q9UJ99 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH22Q9UJ99 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDH22Q9UJ99 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDH22Q9UJ99 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDH22Q9UJ99 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDH22Q9UJ99 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDH22Q9UJ99 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CDH22Q9UJ99 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDH22Q9UJ99 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDH22Q9UJ99 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDH22Q9UJ99 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDH22Q9UJ99 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDH22Q9UJ99 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDH22Q9UJ99 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDH22Q9UJ99 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDH22Q9UJ99 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDH22Q9UJ99 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDH22Q9UJ99 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH22Q9UJ99 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH22Q9UJ99 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH22Q9UJ99 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH22Q9UJ99 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH22Q9UJ99 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH22Q9UJ99 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH22Q9UJ99 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH22Q9UJ99 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH22Q9UJ99 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH22Q9UJ99 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH22Q9UJ99 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH22Q9UJ99 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH22Q9UJ99 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH22Q9UJ99 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH22Q9UJ99 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH22Q9UJ99 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH22Q9UJ99 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH22Q9UJ99 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH22Q9UJ99 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms