Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MBD1Q9UIS9 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MBD1Q9UIS9 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MBD1Q9UIS9 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MBD1Q9UIS9 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
MBD1Q9UIS9 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MBD1Q9UIS9 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MBD1Q9UIS9 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MBD1Q9UIS9 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MBD1Q9UIS9 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MBD1Q9UIS9 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MBD1Q9UIS9 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MBD1Q9UIS9 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MBD1Q9UIS9 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MBD1Q9UIS9 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MBD1Q9UIS9 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MBD1Q9UIS9 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MBD1Q9UIS9 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MBD1Q9UIS9 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MBD1Q9UIS9 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MBD1Q9UIS9 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MBD1Q9UIS9 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MBD1Q9UIS9 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MBD1Q9UIS9 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MBD1Q9UIS9 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MBD1Q9UIS9 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MBD1Q9UIS9 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MBD1Q9UIS9 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MBD1Q9UIS9 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MBD1Q9UIS9 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MBD1Q9UIS9 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MBD1Q9UIS9 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MBD1Q9UIS9 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MBD1Q9UIS9 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MBD1Q9UIS9 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MBD1Q9UIS9 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MBD1Q9UIS9 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MBD1Q9UIS9 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MBD1Q9UIS9 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MBD1Q9UIS9 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MBD1Q9UIS9 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MBD1Q9UIS9 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
MBD1Q9UIS9 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MBD1Q9UIS9 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MBD1Q9UIS9 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MBD1Q9UIS9 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MBD1Q9UIS9 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MBD1Q9UIS9 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MBD1Q9UIS9 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MBD1Q9UIS9 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MBD1Q9UIS9 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MBD1Q9UIS9 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MBD1Q9UIS9 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MBD1Q9UIS9 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MBD1Q9UIS9 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MBD1Q9UIS9 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MBD1Q9UIS9 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MBD1Q9UIS9 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MBD1Q9UIS9 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MBD1Q9UIS9 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
MBD1Q9UIS9 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MBD1Q9UIS9 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MBD1Q9UIS9 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MBD1Q9UIS9 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MBD1Q9UIS9 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MBD1Q9UIS9 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MBD1Q9UIS9 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MBD1Q9UIS9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MBD1Q9UIS9 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MBD1Q9UIS9 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MBD1Q9UIS9 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MBD1Q9UIS9 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MBD1Q9UIS9 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MBD1Q9UIS9 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MBD1Q9UIS9 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MBD1Q9UIS9 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MBD1Q9UIS9 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MBD1Q9UIS9 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MBD1Q9UIS9 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MBD1Q9UIS9 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MBD1Q9UIS9 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
MBD1Q9UIS9 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MBD1Q9UIS9 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
MBD1Q9UIS9 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MBD1Q9UIS9 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MBD1Q9UIS9 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MBD1Q9UIS9 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MBD1Q9UIS9 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MBD1Q9UIS9 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MBD1Q9UIS9 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MBD1Q9UIS9 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MBD1Q9UIS9 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MBD1Q9UIS9 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MBD1Q9UIS9 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
MBD1Q9UIS9 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MBD1Q9UIS9 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MBD1Q9UIS9 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
MBD1Q9UIS9 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MBD1Q9UIS9 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MBD1Q9UIS9 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms