Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NPC1L1Q9UHC9 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NPC1L1Q9UHC9 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NPC1L1Q9UHC9 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NPC1L1Q9UHC9 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NPC1L1Q9UHC9 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NPC1L1Q9UHC9 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
NPC1L1Q9UHC9 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NPC1L1Q9UHC9 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NPC1L1Q9UHC9 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NPC1L1Q9UHC9 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NPC1L1Q9UHC9 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NPC1L1Q9UHC9 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NPC1L1Q9UHC9 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NPC1L1Q9UHC9 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NPC1L1Q9UHC9 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NPC1L1Q9UHC9 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NPC1L1Q9UHC9 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NPC1L1Q9UHC9 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NPC1L1Q9UHC9 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NPC1L1Q9UHC9 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NPC1L1Q9UHC9 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NPC1L1Q9UHC9 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NPC1L1Q9UHC9 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NPC1L1Q9UHC9 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NPC1L1Q9UHC9 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NPC1L1Q9UHC9 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
NPC1L1Q9UHC9 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
NPC1L1Q9UHC9 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NPC1L1Q9UHC9 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NPC1L1Q9UHC9 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NPC1L1Q9UHC9 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NPC1L1Q9UHC9 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NPC1L1Q9UHC9 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NPC1L1Q9UHC9 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NPC1L1Q9UHC9 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NPC1L1Q9UHC9 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NPC1L1Q9UHC9 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NPC1L1Q9UHC9 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NPC1L1Q9UHC9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NPC1L1Q9UHC9 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NPC1L1Q9UHC9 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NPC1L1Q9UHC9 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NPC1L1Q9UHC9 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NPC1L1Q9UHC9 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
NPC1L1Q9UHC9 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NPC1L1Q9UHC9 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
NPC1L1Q9UHC9 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NPC1L1Q9UHC9 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NPC1L1Q9UHC9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NPC1L1Q9UHC9 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NPC1L1Q9UHC9 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NPC1L1Q9UHC9 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NPC1L1Q9UHC9 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NPC1L1Q9UHC9 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NPC1L1Q9UHC9 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
NPC1L1Q9UHC9 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NPC1L1Q9UHC9 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NPC1L1Q9UHC9 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NPC1L1Q9UHC9 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NPC1L1Q9UHC9 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NPC1L1Q9UHC9 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NPC1L1Q9UHC9 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NPC1L1Q9UHC9 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NPC1L1Q9UHC9 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NPC1L1Q9UHC9 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NPC1L1Q9UHC9 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NPC1L1Q9UHC9 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NPC1L1Q9UHC9 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NPC1L1Q9UHC9 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
NPC1L1Q9UHC9 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
NPC1L1Q9UHC9 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NPC1L1Q9UHC9 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NPC1L1Q9UHC9 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
NPC1L1Q9UHC9 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
NPC1L1Q9UHC9 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NPC1L1Q9UHC9 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NPC1L1Q9UHC9 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NPC1L1Q9UHC9 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NPC1L1Q9UHC9 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NPC1L1Q9UHC9 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NPC1L1Q9UHC9 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
NPC1L1Q9UHC9 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NPC1L1Q9UHC9 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NPC1L1Q9UHC9 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NPC1L1Q9UHC9 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
NPC1L1Q9UHC9 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
NPC1L1Q9UHC9 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NPC1L1Q9UHC9 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NPC1L1Q9UHC9 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NPC1L1Q9UHC9 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
NPC1L1Q9UHC9 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NPC1L1Q9UHC9 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NPC1L1Q9UHC9 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
NPC1L1Q9UHC9 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NPC1L1Q9UHC9 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NPC1L1Q9UHC9 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NPC1L1Q9UHC9 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NPC1L1Q9UHC9 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NPC1L1Q9UHC9 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms