Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
MLH3Q9UHC1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
MLH3Q9UHC1 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
MLH3Q9UHC1 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
MLH3Q9UHC1 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
MLH3Q9UHC1 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
MLH3Q9UHC1 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
MLH3Q9UHC1 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
MLH3Q9UHC1 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
MLH3Q9UHC1 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
MLH3Q9UHC1 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
MLH3Q9UHC1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
MLH3Q9UHC1 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
MLH3Q9UHC1 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
MLH3Q9UHC1 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
MLH3Q9UHC1 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
MLH3Q9UHC1 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
MLH3Q9UHC1 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
MLH3Q9UHC1 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
MLH3Q9UHC1 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
MLH3Q9UHC1 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
MLH3Q9UHC1 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
MLH3Q9UHC1 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
MLH3Q9UHC1 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
MLH3Q9UHC1 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
MLH3Q9UHC1 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
MLH3Q9UHC1 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
MLH3Q9UHC1 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
MLH3Q9UHC1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
MLH3Q9UHC1 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
MLH3Q9UHC1 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
MLH3Q9UHC1 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
MLH3Q9UHC1 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC30.18■■■□□ 2.42
MLH3Q9UHC1 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
MLH3Q9UHC1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
MLH3Q9UHC1 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
MLH3Q9UHC1 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
MLH3Q9UHC1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
MLH3Q9UHC1 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
MLH3Q9UHC1 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
MLH3Q9UHC1 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
MLH3Q9UHC1 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
MLH3Q9UHC1 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
MLH3Q9UHC1 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
MLH3Q9UHC1 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
MLH3Q9UHC1 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
MLH3Q9UHC1 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
MLH3Q9UHC1 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
MLH3Q9UHC1 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
MLH3Q9UHC1 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
MLH3Q9UHC1 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
MLH3Q9UHC1 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
MLH3Q9UHC1 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
MLH3Q9UHC1 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
MLH3Q9UHC1 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
MLH3Q9UHC1 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC30.17■■■□□ 2.42
MLH3Q9UHC1 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
MLH3Q9UHC1 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
MLH3Q9UHC1 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
MLH3Q9UHC1 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC30.17■■■□□ 2.42
MLH3Q9UHC1 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
MLH3Q9UHC1 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
MLH3Q9UHC1 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
MLH3Q9UHC1 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
MLH3Q9UHC1 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
MLH3Q9UHC1 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
MLH3Q9UHC1 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
MLH3Q9UHC1 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
MLH3Q9UHC1 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
MLH3Q9UHC1 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
MLH3Q9UHC1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
MLH3Q9UHC1 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
MLH3Q9UHC1 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
MLH3Q9UHC1 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
MLH3Q9UHC1 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
MLH3Q9UHC1 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
MLH3Q9UHC1 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
MLH3Q9UHC1 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
MLH3Q9UHC1 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
MLH3Q9UHC1 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
MLH3Q9UHC1 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
MLH3Q9UHC1 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
MLH3Q9UHC1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
MLH3Q9UHC1 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
MLH3Q9UHC1 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
MLH3Q9UHC1 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
MLH3Q9UHC1 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
MLH3Q9UHC1 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
MLH3Q9UHC1 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
MLH3Q9UHC1 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
MLH3Q9UHC1 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
MLH3Q9UHC1 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
MLH3Q9UHC1 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
MLH3Q9UHC1 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
MLH3Q9UHC1 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
MLH3Q9UHC1 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
MLH3Q9UHC1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
MLH3Q9UHC1 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
MLH3Q9UHC1 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
MLH3Q9UHC1 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms