Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLIP2Q9UDT6 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLIP2Q9UDT6 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLIP2Q9UDT6 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CLIP2Q9UDT6 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLIP2Q9UDT6 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLIP2Q9UDT6 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLIP2Q9UDT6 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLIP2Q9UDT6 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLIP2Q9UDT6 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLIP2Q9UDT6 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLIP2Q9UDT6 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLIP2Q9UDT6 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLIP2Q9UDT6 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLIP2Q9UDT6 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLIP2Q9UDT6 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLIP2Q9UDT6 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLIP2Q9UDT6 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLIP2Q9UDT6 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLIP2Q9UDT6 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CLIP2Q9UDT6 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLIP2Q9UDT6 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLIP2Q9UDT6 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLIP2Q9UDT6 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLIP2Q9UDT6 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLIP2Q9UDT6 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLIP2Q9UDT6 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLIP2Q9UDT6 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLIP2Q9UDT6 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLIP2Q9UDT6 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLIP2Q9UDT6 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLIP2Q9UDT6 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLIP2Q9UDT6 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLIP2Q9UDT6 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLIP2Q9UDT6 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLIP2Q9UDT6 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLIP2Q9UDT6 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLIP2Q9UDT6 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLIP2Q9UDT6 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CLIP2Q9UDT6 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLIP2Q9UDT6 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CLIP2Q9UDT6 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CLIP2Q9UDT6 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLIP2Q9UDT6 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLIP2Q9UDT6 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLIP2Q9UDT6 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLIP2Q9UDT6 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLIP2Q9UDT6 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLIP2Q9UDT6 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLIP2Q9UDT6 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLIP2Q9UDT6 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLIP2Q9UDT6 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLIP2Q9UDT6 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLIP2Q9UDT6 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLIP2Q9UDT6 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLIP2Q9UDT6 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLIP2Q9UDT6 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLIP2Q9UDT6 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLIP2Q9UDT6 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLIP2Q9UDT6 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLIP2Q9UDT6 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLIP2Q9UDT6 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLIP2Q9UDT6 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLIP2Q9UDT6 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLIP2Q9UDT6 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLIP2Q9UDT6 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLIP2Q9UDT6 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLIP2Q9UDT6 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLIP2Q9UDT6 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CLIP2Q9UDT6 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLIP2Q9UDT6 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLIP2Q9UDT6 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLIP2Q9UDT6 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CLIP2Q9UDT6 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLIP2Q9UDT6 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLIP2Q9UDT6 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLIP2Q9UDT6 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLIP2Q9UDT6 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CLIP2Q9UDT6 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CLIP2Q9UDT6 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CLIP2Q9UDT6 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CLIP2Q9UDT6 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CLIP2Q9UDT6 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CLIP2Q9UDT6 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLIP2Q9UDT6 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLIP2Q9UDT6 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLIP2Q9UDT6 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLIP2Q9UDT6 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLIP2Q9UDT6 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLIP2Q9UDT6 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLIP2Q9UDT6 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLIP2Q9UDT6 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CLIP2Q9UDT6 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLIP2Q9UDT6 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLIP2Q9UDT6 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CLIP2Q9UDT6 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CLIP2Q9UDT6 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLIP2Q9UDT6 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLIP2Q9UDT6 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLIP2Q9UDT6 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms