Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
APEX2Q9UBZ4 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
APEX2Q9UBZ4 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
APEX2Q9UBZ4 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
APEX2Q9UBZ4 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
APEX2Q9UBZ4 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APEX2Q9UBZ4 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
APEX2Q9UBZ4 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
APEX2Q9UBZ4 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
APEX2Q9UBZ4 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
APEX2Q9UBZ4 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
APEX2Q9UBZ4 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APEX2Q9UBZ4 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
APEX2Q9UBZ4 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APEX2Q9UBZ4 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APEX2Q9UBZ4 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APEX2Q9UBZ4 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APEX2Q9UBZ4 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APEX2Q9UBZ4 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
APEX2Q9UBZ4 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
APEX2Q9UBZ4 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
APEX2Q9UBZ4 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
APEX2Q9UBZ4 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
APEX2Q9UBZ4 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APEX2Q9UBZ4 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
APEX2Q9UBZ4 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APEX2Q9UBZ4 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
APEX2Q9UBZ4 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APEX2Q9UBZ4 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
APEX2Q9UBZ4 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
APEX2Q9UBZ4 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
APEX2Q9UBZ4 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
APEX2Q9UBZ4 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
APEX2Q9UBZ4 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APEX2Q9UBZ4 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APEX2Q9UBZ4 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APEX2Q9UBZ4 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
APEX2Q9UBZ4 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APEX2Q9UBZ4 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APEX2Q9UBZ4 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
APEX2Q9UBZ4 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
APEX2Q9UBZ4 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
APEX2Q9UBZ4 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
APEX2Q9UBZ4 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
APEX2Q9UBZ4 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
APEX2Q9UBZ4 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APEX2Q9UBZ4 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APEX2Q9UBZ4 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APEX2Q9UBZ4 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APEX2Q9UBZ4 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APEX2Q9UBZ4 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
APEX2Q9UBZ4 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
APEX2Q9UBZ4 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
APEX2Q9UBZ4 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
APEX2Q9UBZ4 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
APEX2Q9UBZ4 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APEX2Q9UBZ4 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
APEX2Q9UBZ4 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APEX2Q9UBZ4 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APEX2Q9UBZ4 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APEX2Q9UBZ4 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
APEX2Q9UBZ4 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
APEX2Q9UBZ4 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
APEX2Q9UBZ4 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APEX2Q9UBZ4 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
APEX2Q9UBZ4 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
APEX2Q9UBZ4 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APEX2Q9UBZ4 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
APEX2Q9UBZ4 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APEX2Q9UBZ4 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
APEX2Q9UBZ4 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APEX2Q9UBZ4 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APEX2Q9UBZ4 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
APEX2Q9UBZ4 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
APEX2Q9UBZ4 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APEX2Q9UBZ4 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
APEX2Q9UBZ4 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APEX2Q9UBZ4 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APEX2Q9UBZ4 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
APEX2Q9UBZ4 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APEX2Q9UBZ4 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APEX2Q9UBZ4 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APEX2Q9UBZ4 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
APEX2Q9UBZ4 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
APEX2Q9UBZ4 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
APEX2Q9UBZ4 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
APEX2Q9UBZ4 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
APEX2Q9UBZ4 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
APEX2Q9UBZ4 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
APEX2Q9UBZ4 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
APEX2Q9UBZ4 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
APEX2Q9UBZ4 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
APEX2Q9UBZ4 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
APEX2Q9UBZ4 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
APEX2Q9UBZ4 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
APEX2Q9UBZ4 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
APEX2Q9UBZ4 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
APEX2Q9UBZ4 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
APEX2Q9UBZ4 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
APEX2Q9UBZ4 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms