Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL13Q9P2N7 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL13Q9P2N7 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL13Q9P2N7 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL13Q9P2N7 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL13Q9P2N7 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL13Q9P2N7 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL13Q9P2N7 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL13Q9P2N7 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL13Q9P2N7 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL13Q9P2N7 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL13Q9P2N7 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL13Q9P2N7 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL13Q9P2N7 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL13Q9P2N7 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL13Q9P2N7 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL13Q9P2N7 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL13Q9P2N7 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL13Q9P2N7 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL13Q9P2N7 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL13Q9P2N7 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL13Q9P2N7 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL13Q9P2N7 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL13Q9P2N7 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL13Q9P2N7 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL13Q9P2N7 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL13Q9P2N7 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL13Q9P2N7 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL13Q9P2N7 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL13Q9P2N7 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL13Q9P2N7 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL13Q9P2N7 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL13Q9P2N7 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL13Q9P2N7 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL13Q9P2N7 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL13Q9P2N7 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL13Q9P2N7 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL13Q9P2N7 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL13Q9P2N7 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL13Q9P2N7 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL13Q9P2N7 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL13Q9P2N7 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL13Q9P2N7 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL13Q9P2N7 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL13Q9P2N7 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL13Q9P2N7 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL13Q9P2N7 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL13Q9P2N7 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL13Q9P2N7 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL13Q9P2N7 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL13Q9P2N7 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL13Q9P2N7 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL13Q9P2N7 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL13Q9P2N7 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL13Q9P2N7 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL13Q9P2N7 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL13Q9P2N7 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL13Q9P2N7 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL13Q9P2N7 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL13Q9P2N7 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL13Q9P2N7 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL13Q9P2N7 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL13Q9P2N7 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL13Q9P2N7 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL13Q9P2N7 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL13Q9P2N7 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL13Q9P2N7 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL13Q9P2N7 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL13Q9P2N7 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL13Q9P2N7 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL13Q9P2N7 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL13Q9P2N7 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL13Q9P2N7 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL13Q9P2N7 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL13Q9P2N7 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL13Q9P2N7 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL13Q9P2N7 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL13Q9P2N7 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL13Q9P2N7 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL13Q9P2N7 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL13Q9P2N7 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL13Q9P2N7 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL13Q9P2N7 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL13Q9P2N7 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL13Q9P2N7 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL13Q9P2N7 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL13Q9P2N7 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL13Q9P2N7 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL13Q9P2N7 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL13Q9P2N7 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL13Q9P2N7 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL13Q9P2N7 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL13Q9P2N7 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL13Q9P2N7 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL13Q9P2N7 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL13Q9P2N7 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL13Q9P2N7 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL13Q9P2N7 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL13Q9P2N7 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL13Q9P2N7 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms