Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
KLHL42Q9P2K6 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
KLHL42Q9P2K6 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
KLHL42Q9P2K6 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
KLHL42Q9P2K6 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
KLHL42Q9P2K6 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
KLHL42Q9P2K6 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLHL42Q9P2K6 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLHL42Q9P2K6 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLHL42Q9P2K6 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLHL42Q9P2K6 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLHL42Q9P2K6 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLHL42Q9P2K6 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLHL42Q9P2K6 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
KLHL42Q9P2K6 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
KLHL42Q9P2K6 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
KLHL42Q9P2K6 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLHL42Q9P2K6 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLHL42Q9P2K6 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLHL42Q9P2K6 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLHL42Q9P2K6 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
KLHL42Q9P2K6 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
KLHL42Q9P2K6 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLHL42Q9P2K6 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLHL42Q9P2K6 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLHL42Q9P2K6 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLHL42Q9P2K6 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLHL42Q9P2K6 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
KLHL42Q9P2K6 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLHL42Q9P2K6 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLHL42Q9P2K6 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLHL42Q9P2K6 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLHL42Q9P2K6 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLHL42Q9P2K6 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLHL42Q9P2K6 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLHL42Q9P2K6 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLHL42Q9P2K6 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLHL42Q9P2K6 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLHL42Q9P2K6 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLHL42Q9P2K6 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLHL42Q9P2K6 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLHL42Q9P2K6 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLHL42Q9P2K6 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLHL42Q9P2K6 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLHL42Q9P2K6 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLHL42Q9P2K6 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLHL42Q9P2K6 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLHL42Q9P2K6 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLHL42Q9P2K6 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLHL42Q9P2K6 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLHL42Q9P2K6 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLHL42Q9P2K6 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLHL42Q9P2K6 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLHL42Q9P2K6 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLHL42Q9P2K6 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLHL42Q9P2K6 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLHL42Q9P2K6 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLHL42Q9P2K6 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLHL42Q9P2K6 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLHL42Q9P2K6 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLHL42Q9P2K6 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLHL42Q9P2K6 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLHL42Q9P2K6 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
KLHL42Q9P2K6 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLHL42Q9P2K6 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLHL42Q9P2K6 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLHL42Q9P2K6 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLHL42Q9P2K6 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLHL42Q9P2K6 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLHL42Q9P2K6 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLHL42Q9P2K6 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLHL42Q9P2K6 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLHL42Q9P2K6 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLHL42Q9P2K6 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLHL42Q9P2K6 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLHL42Q9P2K6 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLHL42Q9P2K6 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL42Q9P2K6 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL42Q9P2K6 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL42Q9P2K6 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL42Q9P2K6 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL42Q9P2K6 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL42Q9P2K6 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL42Q9P2K6 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL42Q9P2K6 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL42Q9P2K6 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL42Q9P2K6 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL42Q9P2K6 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL42Q9P2K6 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL42Q9P2K6 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL42Q9P2K6 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL42Q9P2K6 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL42Q9P2K6 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL42Q9P2K6 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL42Q9P2K6 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL42Q9P2K6 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL42Q9P2K6 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL42Q9P2K6 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KLHL42Q9P2K6 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KLHL42Q9P2K6 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms