Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J2

IGSF9, Protein turtle homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9Q9P2J2 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IGSF9Q9P2J2 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
IGSF9Q9P2J2 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IGSF9Q9P2J2 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
IGSF9Q9P2J2 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
IGSF9Q9P2J2 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.31■■□□□ 1
IGSF9Q9P2J2 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
IGSF9Q9P2J2 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IGSF9Q9P2J2 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
IGSF9Q9P2J2 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
IGSF9Q9P2J2 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.31■■□□□ 1
IGSF9Q9P2J2 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IGSF9Q9P2J2 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IGSF9Q9P2J2 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IGSF9Q9P2J2 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IGSF9Q9P2J2 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IGSF9Q9P2J2 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
IGSF9Q9P2J2 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IGSF9Q9P2J2 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IGSF9Q9P2J2 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IGSF9Q9P2J2 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IGSF9Q9P2J2 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
IGSF9Q9P2J2 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
IGSF9Q9P2J2 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IGSF9Q9P2J2 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
IGSF9Q9P2J2 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IGSF9Q9P2J2 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IGSF9Q9P2J2 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IGSF9Q9P2J2 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IGSF9Q9P2J2 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IGSF9Q9P2J2 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IGSF9Q9P2J2 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
IGSF9Q9P2J2 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IGSF9Q9P2J2 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
IGSF9Q9P2J2 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
IGSF9Q9P2J2 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
IGSF9Q9P2J2 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IGSF9Q9P2J2 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
IGSF9Q9P2J2 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
IGSF9Q9P2J2 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.3■■□□□ 1
IGSF9Q9P2J2 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IGSF9Q9P2J2 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IGSF9Q9P2J2 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.3■■□□□ 1
IGSF9Q9P2J2 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IGSF9Q9P2J2 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IGSF9Q9P2J2 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
IGSF9Q9P2J2 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IGSF9Q9P2J2 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IGSF9Q9P2J2 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
IGSF9Q9P2J2 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IGSF9Q9P2J2 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
IGSF9Q9P2J2 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IGSF9Q9P2J2 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IGSF9Q9P2J2 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IGSF9Q9P2J2 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IGSF9Q9P2J2 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
IGSF9Q9P2J2 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IGSF9Q9P2J2 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
IGSF9Q9P2J2 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
IGSF9Q9P2J2 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IGSF9Q9P2J2 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IGSF9Q9P2J2 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IGSF9Q9P2J2 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IGSF9Q9P2J2 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IGSF9Q9P2J2 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IGSF9Q9P2J2 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IGSF9Q9P2J2 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
IGSF9Q9P2J2 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IGSF9Q9P2J2 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.29■■□□□ 1
IGSF9Q9P2J2 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IGSF9Q9P2J2 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IGSF9Q9P2J2 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IGSF9Q9P2J2 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IGSF9Q9P2J2 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
IGSF9Q9P2J2 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IGSF9Q9P2J2 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IGSF9Q9P2J2 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IGSF9Q9P2J2 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IGSF9Q9P2J2 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IGSF9Q9P2J2 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IGSF9Q9P2J2 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
IGSF9Q9P2J2 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IGSF9Q9P2J2 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IGSF9Q9P2J2 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21.28■■□□□ 1
IGSF9Q9P2J2 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
IGSF9Q9P2J2 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IGSF9Q9P2J2 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
IGSF9Q9P2J2 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
IGSF9Q9P2J2 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IGSF9Q9P2J2 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IGSF9Q9P2J2 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IGSF9Q9P2J2 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IGSF9Q9P2J2 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IGSF9Q9P2J2 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IGSF9Q9P2J2 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IGSF9Q9P2J2 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IGSF9Q9P2J2 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IGSF9Q9P2J2 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
IGSF9Q9P2J2 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
IGSF9Q9P2J2 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms