Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1U0

ZNRD1, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA12, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRD1Q9P1U0 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNRD1Q9P1U0 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNRD1Q9P1U0 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNRD1Q9P1U0 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNRD1Q9P1U0 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNRD1Q9P1U0 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNRD1Q9P1U0 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNRD1Q9P1U0 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNRD1Q9P1U0 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNRD1Q9P1U0 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNRD1Q9P1U0 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNRD1Q9P1U0 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNRD1Q9P1U0 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNRD1Q9P1U0 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNRD1Q9P1U0 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNRD1Q9P1U0 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNRD1Q9P1U0 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNRD1Q9P1U0 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNRD1Q9P1U0 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNRD1Q9P1U0 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNRD1Q9P1U0 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNRD1Q9P1U0 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNRD1Q9P1U0 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNRD1Q9P1U0 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNRD1Q9P1U0 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNRD1Q9P1U0 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNRD1Q9P1U0 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNRD1Q9P1U0 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNRD1Q9P1U0 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNRD1Q9P1U0 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNRD1Q9P1U0 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNRD1Q9P1U0 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNRD1Q9P1U0 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNRD1Q9P1U0 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNRD1Q9P1U0 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNRD1Q9P1U0 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNRD1Q9P1U0 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNRD1Q9P1U0 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNRD1Q9P1U0 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNRD1Q9P1U0 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNRD1Q9P1U0 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNRD1Q9P1U0 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNRD1Q9P1U0 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNRD1Q9P1U0 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNRD1Q9P1U0 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNRD1Q9P1U0 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNRD1Q9P1U0 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNRD1Q9P1U0 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNRD1Q9P1U0 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNRD1Q9P1U0 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNRD1Q9P1U0 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNRD1Q9P1U0 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNRD1Q9P1U0 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNRD1Q9P1U0 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNRD1Q9P1U0 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNRD1Q9P1U0 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNRD1Q9P1U0 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNRD1Q9P1U0 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNRD1Q9P1U0 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNRD1Q9P1U0 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNRD1Q9P1U0 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNRD1Q9P1U0 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNRD1Q9P1U0 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNRD1Q9P1U0 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNRD1Q9P1U0 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNRD1Q9P1U0 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNRD1Q9P1U0 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNRD1Q9P1U0 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNRD1Q9P1U0 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNRD1Q9P1U0 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNRD1Q9P1U0 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNRD1Q9P1U0 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNRD1Q9P1U0 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNRD1Q9P1U0 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNRD1Q9P1U0 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNRD1Q9P1U0 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNRD1Q9P1U0 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNRD1Q9P1U0 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNRD1Q9P1U0 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNRD1Q9P1U0 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNRD1Q9P1U0 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNRD1Q9P1U0 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNRD1Q9P1U0 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNRD1Q9P1U0 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNRD1Q9P1U0 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNRD1Q9P1U0 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNRD1Q9P1U0 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNRD1Q9P1U0 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNRD1Q9P1U0 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNRD1Q9P1U0 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNRD1Q9P1U0 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNRD1Q9P1U0 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNRD1Q9P1U0 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNRD1Q9P1U0 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNRD1Q9P1U0 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNRD1Q9P1U0 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNRD1Q9P1U0 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNRD1Q9P1U0 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNRD1Q9P1U0 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNRD1Q9P1U0 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms