Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYA4

MTMR4, Myotubularin-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR4Q9NYA4 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MTMR4Q9NYA4 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MTMR4Q9NYA4 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MTMR4Q9NYA4 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MTMR4Q9NYA4 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MTMR4Q9NYA4 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MTMR4Q9NYA4 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MTMR4Q9NYA4 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MTMR4Q9NYA4 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MTMR4Q9NYA4 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MTMR4Q9NYA4 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MTMR4Q9NYA4 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MTMR4Q9NYA4 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MTMR4Q9NYA4 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MTMR4Q9NYA4 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MTMR4Q9NYA4 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MTMR4Q9NYA4 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MTMR4Q9NYA4 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MTMR4Q9NYA4 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MTMR4Q9NYA4 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MTMR4Q9NYA4 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MTMR4Q9NYA4 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MTMR4Q9NYA4 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MTMR4Q9NYA4 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MTMR4Q9NYA4 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTMR4Q9NYA4 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTMR4Q9NYA4 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTMR4Q9NYA4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTMR4Q9NYA4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTMR4Q9NYA4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTMR4Q9NYA4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTMR4Q9NYA4 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTMR4Q9NYA4 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTMR4Q9NYA4 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTMR4Q9NYA4 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTMR4Q9NYA4 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTMR4Q9NYA4 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTMR4Q9NYA4 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTMR4Q9NYA4 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTMR4Q9NYA4 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTMR4Q9NYA4 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
MTMR4Q9NYA4 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTMR4Q9NYA4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTMR4Q9NYA4 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTMR4Q9NYA4 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTMR4Q9NYA4 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTMR4Q9NYA4 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTMR4Q9NYA4 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTMR4Q9NYA4 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTMR4Q9NYA4 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTMR4Q9NYA4 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
MTMR4Q9NYA4 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MTMR4Q9NYA4 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MTMR4Q9NYA4 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MTMR4Q9NYA4 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MTMR4Q9NYA4 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MTMR4Q9NYA4 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MTMR4Q9NYA4 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MTMR4Q9NYA4 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MTMR4Q9NYA4 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MTMR4Q9NYA4 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MTMR4Q9NYA4 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MTMR4Q9NYA4 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MTMR4Q9NYA4 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MTMR4Q9NYA4 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MTMR4Q9NYA4 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MTMR4Q9NYA4 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MTMR4Q9NYA4 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MTMR4Q9NYA4 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MTMR4Q9NYA4 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MTMR4Q9NYA4 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MTMR4Q9NYA4 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MTMR4Q9NYA4 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MTMR4Q9NYA4 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MTMR4Q9NYA4 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
MTMR4Q9NYA4 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MTMR4Q9NYA4 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
MTMR4Q9NYA4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MTMR4Q9NYA4 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MTMR4Q9NYA4 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MTMR4Q9NYA4 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MTMR4Q9NYA4 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MTMR4Q9NYA4 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MTMR4Q9NYA4 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTMR4Q9NYA4 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTMR4Q9NYA4 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTMR4Q9NYA4 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTMR4Q9NYA4 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTMR4Q9NYA4 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTMR4Q9NYA4 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
MTMR4Q9NYA4 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTMR4Q9NYA4 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTMR4Q9NYA4 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTMR4Q9NYA4 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTMR4Q9NYA4 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTMR4Q9NYA4 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTMR4Q9NYA4 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTMR4Q9NYA4 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
MTMR4Q9NYA4 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
MTMR4Q9NYA4 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms