Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX77

ERVK13-1, Endogenous retrovirus group K member 13-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK13-1Q9NX77 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms