Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW38

FANCL, E3 ubiquitin-protein ligase FANCL, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCLQ9NW38 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FANCLQ9NW38 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FANCLQ9NW38 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FANCLQ9NW38 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FANCLQ9NW38 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FANCLQ9NW38 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FANCLQ9NW38 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FANCLQ9NW38 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FANCLQ9NW38 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FANCLQ9NW38 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FANCLQ9NW38 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FANCLQ9NW38 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FANCLQ9NW38 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FANCLQ9NW38 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FANCLQ9NW38 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FANCLQ9NW38 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FANCLQ9NW38 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FANCLQ9NW38 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FANCLQ9NW38 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FANCLQ9NW38 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FANCLQ9NW38 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FANCLQ9NW38 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FANCLQ9NW38 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FANCLQ9NW38 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FANCLQ9NW38 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FANCLQ9NW38 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FANCLQ9NW38 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FANCLQ9NW38 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FANCLQ9NW38 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FANCLQ9NW38 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FANCLQ9NW38 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FANCLQ9NW38 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FANCLQ9NW38 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FANCLQ9NW38 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FANCLQ9NW38 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FANCLQ9NW38 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FANCLQ9NW38 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FANCLQ9NW38 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
FANCLQ9NW38 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
FANCLQ9NW38 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
FANCLQ9NW38 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
FANCLQ9NW38 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
FANCLQ9NW38 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FANCLQ9NW38 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FANCLQ9NW38 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FANCLQ9NW38 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FANCLQ9NW38 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FANCLQ9NW38 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FANCLQ9NW38 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FANCLQ9NW38 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FANCLQ9NW38 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FANCLQ9NW38 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FANCLQ9NW38 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FANCLQ9NW38 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FANCLQ9NW38 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FANCLQ9NW38 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FANCLQ9NW38 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FANCLQ9NW38 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FANCLQ9NW38 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FANCLQ9NW38 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FANCLQ9NW38 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FANCLQ9NW38 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FANCLQ9NW38 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FANCLQ9NW38 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FANCLQ9NW38 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FANCLQ9NW38 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FANCLQ9NW38 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FANCLQ9NW38 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FANCLQ9NW38 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FANCLQ9NW38 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FANCLQ9NW38 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FANCLQ9NW38 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FANCLQ9NW38 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FANCLQ9NW38 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FANCLQ9NW38 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FANCLQ9NW38 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FANCLQ9NW38 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FANCLQ9NW38 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FANCLQ9NW38 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FANCLQ9NW38 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FANCLQ9NW38 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FANCLQ9NW38 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FANCLQ9NW38 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FANCLQ9NW38 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FANCLQ9NW38 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FANCLQ9NW38 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FANCLQ9NW38 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FANCLQ9NW38 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FANCLQ9NW38 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FANCLQ9NW38 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FANCLQ9NW38 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FANCLQ9NW38 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FANCLQ9NW38 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
FANCLQ9NW38 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FANCLQ9NW38 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FANCLQ9NW38 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FANCLQ9NW38 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FANCLQ9NW38 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FANCLQ9NW38 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FANCLQ9NW38 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms