Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVX2

NLE1, Notchless protein homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLE1Q9NVX2 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLE1Q9NVX2 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLE1Q9NVX2 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLE1Q9NVX2 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLE1Q9NVX2 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLE1Q9NVX2 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLE1Q9NVX2 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLE1Q9NVX2 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLE1Q9NVX2 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLE1Q9NVX2 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLE1Q9NVX2 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLE1Q9NVX2 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLE1Q9NVX2 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLE1Q9NVX2 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLE1Q9NVX2 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLE1Q9NVX2 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLE1Q9NVX2 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NLE1Q9NVX2 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLE1Q9NVX2 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NLE1Q9NVX2 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLE1Q9NVX2 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLE1Q9NVX2 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLE1Q9NVX2 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLE1Q9NVX2 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLE1Q9NVX2 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLE1Q9NVX2 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLE1Q9NVX2 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLE1Q9NVX2 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLE1Q9NVX2 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLE1Q9NVX2 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NLE1Q9NVX2 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLE1Q9NVX2 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLE1Q9NVX2 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLE1Q9NVX2 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLE1Q9NVX2 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLE1Q9NVX2 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLE1Q9NVX2 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLE1Q9NVX2 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLE1Q9NVX2 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NLE1Q9NVX2 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLE1Q9NVX2 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLE1Q9NVX2 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLE1Q9NVX2 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLE1Q9NVX2 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLE1Q9NVX2 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLE1Q9NVX2 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLE1Q9NVX2 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLE1Q9NVX2 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLE1Q9NVX2 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLE1Q9NVX2 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLE1Q9NVX2 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLE1Q9NVX2 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLE1Q9NVX2 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLE1Q9NVX2 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLE1Q9NVX2 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLE1Q9NVX2 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLE1Q9NVX2 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLE1Q9NVX2 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLE1Q9NVX2 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLE1Q9NVX2 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLE1Q9NVX2 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NLE1Q9NVX2 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLE1Q9NVX2 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NLE1Q9NVX2 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLE1Q9NVX2 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLE1Q9NVX2 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLE1Q9NVX2 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLE1Q9NVX2 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLE1Q9NVX2 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLE1Q9NVX2 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLE1Q9NVX2 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NLE1Q9NVX2 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NLE1Q9NVX2 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NLE1Q9NVX2 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NLE1Q9NVX2 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NLE1Q9NVX2 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NLE1Q9NVX2 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NLE1Q9NVX2 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NLE1Q9NVX2 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NLE1Q9NVX2 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NLE1Q9NVX2 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NLE1Q9NVX2 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NLE1Q9NVX2 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NLE1Q9NVX2 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NLE1Q9NVX2 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NLE1Q9NVX2 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NLE1Q9NVX2 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NLE1Q9NVX2 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NLE1Q9NVX2 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NLE1Q9NVX2 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NLE1Q9NVX2 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NLE1Q9NVX2 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NLE1Q9NVX2 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NLE1Q9NVX2 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NLE1Q9NVX2 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NLE1Q9NVX2 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NLE1Q9NVX2 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NLE1Q9NVX2 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NLE1Q9NVX2 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NLE1Q9NVX2 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms