Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM3

SLC39A9, Zinc transporter ZIP9, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A9Q9NUM3 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms