Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS4

TMPRSS4, Transmembrane protease serine 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS4Q9NRS4 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMPRSS4Q9NRS4 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMPRSS4Q9NRS4 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMPRSS4Q9NRS4 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMPRSS4Q9NRS4 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMPRSS4Q9NRS4 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
TMPRSS4Q9NRS4 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMPRSS4Q9NRS4 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMPRSS4Q9NRS4 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMPRSS4Q9NRS4 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMPRSS4Q9NRS4 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMPRSS4Q9NRS4 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMPRSS4Q9NRS4 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMPRSS4Q9NRS4 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMPRSS4Q9NRS4 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMPRSS4Q9NRS4 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMPRSS4Q9NRS4 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMPRSS4Q9NRS4 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMPRSS4Q9NRS4 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMPRSS4Q9NRS4 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
TMPRSS4Q9NRS4 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMPRSS4Q9NRS4 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMPRSS4Q9NRS4 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMPRSS4Q9NRS4 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMPRSS4Q9NRS4 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMPRSS4Q9NRS4 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMPRSS4Q9NRS4 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMPRSS4Q9NRS4 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMPRSS4Q9NRS4 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMPRSS4Q9NRS4 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMPRSS4Q9NRS4 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMPRSS4Q9NRS4 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMPRSS4Q9NRS4 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMPRSS4Q9NRS4 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
TMPRSS4Q9NRS4 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMPRSS4Q9NRS4 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMPRSS4Q9NRS4 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
TMPRSS4Q9NRS4 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMPRSS4Q9NRS4 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMPRSS4Q9NRS4 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMPRSS4Q9NRS4 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMPRSS4Q9NRS4 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
TMPRSS4Q9NRS4 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMPRSS4Q9NRS4 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMPRSS4Q9NRS4 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMPRSS4Q9NRS4 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMPRSS4Q9NRS4 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMPRSS4Q9NRS4 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMPRSS4Q9NRS4 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMPRSS4Q9NRS4 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
TMPRSS4Q9NRS4 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMPRSS4Q9NRS4 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMPRSS4Q9NRS4 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMPRSS4Q9NRS4 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMPRSS4Q9NRS4 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMPRSS4Q9NRS4 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMPRSS4Q9NRS4 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMPRSS4Q9NRS4 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMPRSS4Q9NRS4 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMPRSS4Q9NRS4 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMPRSS4Q9NRS4 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
TMPRSS4Q9NRS4 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMPRSS4Q9NRS4 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMPRSS4Q9NRS4 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
TMPRSS4Q9NRS4 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMPRSS4Q9NRS4 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMPRSS4Q9NRS4 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMPRSS4Q9NRS4 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMPRSS4Q9NRS4 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMPRSS4Q9NRS4 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMPRSS4Q9NRS4 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMPRSS4Q9NRS4 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMPRSS4Q9NRS4 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMPRSS4Q9NRS4 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMPRSS4Q9NRS4 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMPRSS4Q9NRS4 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMPRSS4Q9NRS4 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMPRSS4Q9NRS4 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMPRSS4Q9NRS4 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMPRSS4Q9NRS4 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMPRSS4Q9NRS4 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMPRSS4Q9NRS4 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMPRSS4Q9NRS4 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMPRSS4Q9NRS4 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMPRSS4Q9NRS4 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMPRSS4Q9NRS4 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMPRSS4Q9NRS4 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMPRSS4Q9NRS4 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMPRSS4Q9NRS4 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMPRSS4Q9NRS4 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMPRSS4Q9NRS4 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMPRSS4Q9NRS4 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMPRSS4Q9NRS4 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMPRSS4Q9NRS4 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMPRSS4Q9NRS4 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMPRSS4Q9NRS4 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMPRSS4Q9NRS4 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMPRSS4Q9NRS4 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMPRSS4Q9NRS4 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms