Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQG5

RPRD1B, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1BQ9NQG5 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms