Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC3

RTN4, Reticulon-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN4Q9NQC3 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RTN4Q9NQC3 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RTN4Q9NQC3 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RTN4Q9NQC3 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RTN4Q9NQC3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RTN4Q9NQC3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RTN4Q9NQC3 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RTN4Q9NQC3 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RTN4Q9NQC3 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RTN4Q9NQC3 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RTN4Q9NQC3 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RTN4Q9NQC3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RTN4Q9NQC3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RTN4Q9NQC3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RTN4Q9NQC3 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RTN4Q9NQC3 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RTN4Q9NQC3 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RTN4Q9NQC3 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RTN4Q9NQC3 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RTN4Q9NQC3 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RTN4Q9NQC3 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RTN4Q9NQC3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RTN4Q9NQC3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RTN4Q9NQC3 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RTN4Q9NQC3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RTN4Q9NQC3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RTN4Q9NQC3 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RTN4Q9NQC3 AC120057.1-201ENST00000483947 663 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RTN4Q9NQC3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RTN4Q9NQC3 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RTN4Q9NQC3 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RTN4Q9NQC3 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RTN4Q9NQC3 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RTN4Q9NQC3 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RTN4Q9NQC3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RTN4Q9NQC3 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RTN4Q9NQC3 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RTN4Q9NQC3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RTN4Q9NQC3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RTN4Q9NQC3 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RTN4Q9NQC3 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RTN4Q9NQC3 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RTN4Q9NQC3 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RTN4Q9NQC3 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RTN4Q9NQC3 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RTN4Q9NQC3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RTN4Q9NQC3 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RTN4Q9NQC3 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RTN4Q9NQC3 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RTN4Q9NQC3 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RTN4Q9NQC3 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RTN4Q9NQC3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RTN4Q9NQC3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RTN4Q9NQC3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RTN4Q9NQC3 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RTN4Q9NQC3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RTN4Q9NQC3 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RTN4Q9NQC3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RTN4Q9NQC3 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RTN4Q9NQC3 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RTN4Q9NQC3 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RTN4Q9NQC3 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RTN4Q9NQC3 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RTN4Q9NQC3 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RTN4Q9NQC3 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RTN4Q9NQC3 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RTN4Q9NQC3 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RTN4Q9NQC3 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RTN4Q9NQC3 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RTN4Q9NQC3 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RTN4Q9NQC3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RTN4Q9NQC3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RTN4Q9NQC3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RTN4Q9NQC3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RTN4Q9NQC3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RTN4Q9NQC3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RTN4Q9NQC3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RTN4Q9NQC3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RTN4Q9NQC3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RTN4Q9NQC3 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RTN4Q9NQC3 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RTN4Q9NQC3 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RTN4Q9NQC3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RTN4Q9NQC3 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RTN4Q9NQC3 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RTN4Q9NQC3 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RTN4Q9NQC3 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RTN4Q9NQC3 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RTN4Q9NQC3 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RTN4Q9NQC3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RTN4Q9NQC3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RTN4Q9NQC3 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RTN4Q9NQC3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RTN4Q9NQC3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RTN4Q9NQC3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RTN4Q9NQC3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RTN4Q9NQC3 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RTN4Q9NQC3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RTN4Q9NQC3 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RTN4Q9NQC3 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms