Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZCCHC17Q9NP64 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZCCHC17Q9NP64 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZCCHC17Q9NP64 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZCCHC17Q9NP64 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ZCCHC17Q9NP64 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZCCHC17Q9NP64 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ZCCHC17Q9NP64 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZCCHC17Q9NP64 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZCCHC17Q9NP64 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZCCHC17Q9NP64 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZCCHC17Q9NP64 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZCCHC17Q9NP64 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZCCHC17Q9NP64 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZCCHC17Q9NP64 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZCCHC17Q9NP64 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZCCHC17Q9NP64 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZCCHC17Q9NP64 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZCCHC17Q9NP64 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZCCHC17Q9NP64 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZCCHC17Q9NP64 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZCCHC17Q9NP64 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZCCHC17Q9NP64 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZCCHC17Q9NP64 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZCCHC17Q9NP64 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ZCCHC17Q9NP64 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ZCCHC17Q9NP64 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZCCHC17Q9NP64 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZCCHC17Q9NP64 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZCCHC17Q9NP64 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZCCHC17Q9NP64 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZCCHC17Q9NP64 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZCCHC17Q9NP64 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZCCHC17Q9NP64 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ZCCHC17Q9NP64 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZCCHC17Q9NP64 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZCCHC17Q9NP64 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZCCHC17Q9NP64 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZCCHC17Q9NP64 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ZCCHC17Q9NP64 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ZCCHC17Q9NP64 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZCCHC17Q9NP64 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZCCHC17Q9NP64 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZCCHC17Q9NP64 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZCCHC17Q9NP64 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZCCHC17Q9NP64 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZCCHC17Q9NP64 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZCCHC17Q9NP64 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZCCHC17Q9NP64 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZCCHC17Q9NP64 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZCCHC17Q9NP64 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZCCHC17Q9NP64 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZCCHC17Q9NP64 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZCCHC17Q9NP64 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZCCHC17Q9NP64 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ZCCHC17Q9NP64 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZCCHC17Q9NP64 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZCCHC17Q9NP64 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZCCHC17Q9NP64 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZCCHC17Q9NP64 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ZCCHC17Q9NP64 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ZCCHC17Q9NP64 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZCCHC17Q9NP64 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZCCHC17Q9NP64 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZCCHC17Q9NP64 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZCCHC17Q9NP64 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZCCHC17Q9NP64 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZCCHC17Q9NP64 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZCCHC17Q9NP64 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZCCHC17Q9NP64 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZCCHC17Q9NP64 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZCCHC17Q9NP64 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZCCHC17Q9NP64 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZCCHC17Q9NP64 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZCCHC17Q9NP64 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZCCHC17Q9NP64 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZCCHC17Q9NP64 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZCCHC17Q9NP64 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZCCHC17Q9NP64 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZCCHC17Q9NP64 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZCCHC17Q9NP64 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZCCHC17Q9NP64 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZCCHC17Q9NP64 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZCCHC17Q9NP64 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZCCHC17Q9NP64 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZCCHC17Q9NP64 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZCCHC17Q9NP64 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZCCHC17Q9NP64 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZCCHC17Q9NP64 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZCCHC17Q9NP64 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZCCHC17Q9NP64 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZCCHC17Q9NP64 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZCCHC17Q9NP64 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZCCHC17Q9NP64 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZCCHC17Q9NP64 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZCCHC17Q9NP64 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZCCHC17Q9NP64 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZCCHC17Q9NP64 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZCCHC17Q9NP64 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZCCHC17Q9NP64 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms