Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ARFGAP3Q9NP61 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARFGAP3Q9NP61 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARFGAP3Q9NP61 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARFGAP3Q9NP61 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARFGAP3Q9NP61 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARFGAP3Q9NP61 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARFGAP3Q9NP61 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARFGAP3Q9NP61 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARFGAP3Q9NP61 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARFGAP3Q9NP61 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARFGAP3Q9NP61 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARFGAP3Q9NP61 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARFGAP3Q9NP61 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARFGAP3Q9NP61 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARFGAP3Q9NP61 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARFGAP3Q9NP61 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARFGAP3Q9NP61 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARFGAP3Q9NP61 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARFGAP3Q9NP61 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARFGAP3Q9NP61 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARFGAP3Q9NP61 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARFGAP3Q9NP61 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARFGAP3Q9NP61 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARFGAP3Q9NP61 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARFGAP3Q9NP61 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARFGAP3Q9NP61 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARFGAP3Q9NP61 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARFGAP3Q9NP61 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARFGAP3Q9NP61 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARFGAP3Q9NP61 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARFGAP3Q9NP61 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARFGAP3Q9NP61 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARFGAP3Q9NP61 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARFGAP3Q9NP61 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARFGAP3Q9NP61 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ARFGAP3Q9NP61 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARFGAP3Q9NP61 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARFGAP3Q9NP61 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARFGAP3Q9NP61 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARFGAP3Q9NP61 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARFGAP3Q9NP61 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARFGAP3Q9NP61 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARFGAP3Q9NP61 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARFGAP3Q9NP61 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARFGAP3Q9NP61 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARFGAP3Q9NP61 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARFGAP3Q9NP61 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARFGAP3Q9NP61 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ARFGAP3Q9NP61 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARFGAP3Q9NP61 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARFGAP3Q9NP61 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARFGAP3Q9NP61 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARFGAP3Q9NP61 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARFGAP3Q9NP61 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARFGAP3Q9NP61 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARFGAP3Q9NP61 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARFGAP3Q9NP61 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARFGAP3Q9NP61 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARFGAP3Q9NP61 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARFGAP3Q9NP61 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARFGAP3Q9NP61 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ARFGAP3Q9NP61 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARFGAP3Q9NP61 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARFGAP3Q9NP61 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARFGAP3Q9NP61 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARFGAP3Q9NP61 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARFGAP3Q9NP61 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARFGAP3Q9NP61 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARFGAP3Q9NP61 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARFGAP3Q9NP61 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARFGAP3Q9NP61 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARFGAP3Q9NP61 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARFGAP3Q9NP61 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARFGAP3Q9NP61 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARFGAP3Q9NP61 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARFGAP3Q9NP61 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARFGAP3Q9NP61 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARFGAP3Q9NP61 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARFGAP3Q9NP61 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARFGAP3Q9NP61 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARFGAP3Q9NP61 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ARFGAP3Q9NP61 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARFGAP3Q9NP61 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ARFGAP3Q9NP61 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARFGAP3Q9NP61 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARFGAP3Q9NP61 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARFGAP3Q9NP61 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARFGAP3Q9NP61 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARFGAP3Q9NP61 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARFGAP3Q9NP61 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARFGAP3Q9NP61 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARFGAP3Q9NP61 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARFGAP3Q9NP61 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARFGAP3Q9NP61 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARFGAP3Q9NP61 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARFGAP3Q9NP61 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARFGAP3Q9NP61 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARFGAP3Q9NP61 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARFGAP3Q9NP61 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms