Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNX1

TUFT1, Tuftelin, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUFT1Q9NNX1 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUFT1Q9NNX1 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TUFT1Q9NNX1 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TUFT1Q9NNX1 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUFT1Q9NNX1 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUFT1Q9NNX1 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUFT1Q9NNX1 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUFT1Q9NNX1 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUFT1Q9NNX1 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUFT1Q9NNX1 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUFT1Q9NNX1 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUFT1Q9NNX1 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUFT1Q9NNX1 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUFT1Q9NNX1 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUFT1Q9NNX1 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TUFT1Q9NNX1 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUFT1Q9NNX1 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUFT1Q9NNX1 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUFT1Q9NNX1 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUFT1Q9NNX1 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUFT1Q9NNX1 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUFT1Q9NNX1 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUFT1Q9NNX1 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUFT1Q9NNX1 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TUFT1Q9NNX1 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUFT1Q9NNX1 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUFT1Q9NNX1 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUFT1Q9NNX1 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUFT1Q9NNX1 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUFT1Q9NNX1 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUFT1Q9NNX1 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUFT1Q9NNX1 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUFT1Q9NNX1 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUFT1Q9NNX1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUFT1Q9NNX1 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUFT1Q9NNX1 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUFT1Q9NNX1 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUFT1Q9NNX1 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUFT1Q9NNX1 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TUFT1Q9NNX1 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUFT1Q9NNX1 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUFT1Q9NNX1 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUFT1Q9NNX1 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TUFT1Q9NNX1 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TUFT1Q9NNX1 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUFT1Q9NNX1 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TUFT1Q9NNX1 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TUFT1Q9NNX1 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUFT1Q9NNX1 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUFT1Q9NNX1 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUFT1Q9NNX1 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUFT1Q9NNX1 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUFT1Q9NNX1 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUFT1Q9NNX1 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUFT1Q9NNX1 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TUFT1Q9NNX1 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUFT1Q9NNX1 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUFT1Q9NNX1 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUFT1Q9NNX1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUFT1Q9NNX1 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUFT1Q9NNX1 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUFT1Q9NNX1 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUFT1Q9NNX1 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
TUFT1Q9NNX1 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TUFT1Q9NNX1 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TUFT1Q9NNX1 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TUFT1Q9NNX1 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUFT1Q9NNX1 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUFT1Q9NNX1 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUFT1Q9NNX1 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUFT1Q9NNX1 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUFT1Q9NNX1 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUFT1Q9NNX1 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUFT1Q9NNX1 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TUFT1Q9NNX1 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUFT1Q9NNX1 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUFT1Q9NNX1 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUFT1Q9NNX1 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUFT1Q9NNX1 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUFT1Q9NNX1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUFT1Q9NNX1 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUFT1Q9NNX1 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUFT1Q9NNX1 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUFT1Q9NNX1 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUFT1Q9NNX1 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUFT1Q9NNX1 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUFT1Q9NNX1 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUFT1Q9NNX1 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUFT1Q9NNX1 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUFT1Q9NNX1 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUFT1Q9NNX1 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUFT1Q9NNX1 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUFT1Q9NNX1 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUFT1Q9NNX1 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUFT1Q9NNX1 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUFT1Q9NNX1 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUFT1Q9NNX1 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUFT1Q9NNX1 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUFT1Q9NNX1 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUFT1Q9NNX1 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms