Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU9

BRMS1, Breast cancer metastasis-suppressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1Q9HCU9 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BRMS1Q9HCU9 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BRMS1Q9HCU9 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BRMS1Q9HCU9 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BRMS1Q9HCU9 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BRMS1Q9HCU9 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BRMS1Q9HCU9 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BRMS1Q9HCU9 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BRMS1Q9HCU9 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BRMS1Q9HCU9 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BRMS1Q9HCU9 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
BRMS1Q9HCU9 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRMS1Q9HCU9 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRMS1Q9HCU9 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRMS1Q9HCU9 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRMS1Q9HCU9 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRMS1Q9HCU9 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRMS1Q9HCU9 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRMS1Q9HCU9 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRMS1Q9HCU9 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
BRMS1Q9HCU9 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRMS1Q9HCU9 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRMS1Q9HCU9 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRMS1Q9HCU9 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRMS1Q9HCU9 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRMS1Q9HCU9 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRMS1Q9HCU9 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRMS1Q9HCU9 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRMS1Q9HCU9 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRMS1Q9HCU9 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRMS1Q9HCU9 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
BRMS1Q9HCU9 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRMS1Q9HCU9 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRMS1Q9HCU9 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRMS1Q9HCU9 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRMS1Q9HCU9 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRMS1Q9HCU9 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRMS1Q9HCU9 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRMS1Q9HCU9 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRMS1Q9HCU9 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRMS1Q9HCU9 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRMS1Q9HCU9 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRMS1Q9HCU9 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRMS1Q9HCU9 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRMS1Q9HCU9 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRMS1Q9HCU9 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRMS1Q9HCU9 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRMS1Q9HCU9 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRMS1Q9HCU9 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRMS1Q9HCU9 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRMS1Q9HCU9 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRMS1Q9HCU9 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRMS1Q9HCU9 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRMS1Q9HCU9 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRMS1Q9HCU9 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRMS1Q9HCU9 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
BRMS1Q9HCU9 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
BRMS1Q9HCU9 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRMS1Q9HCU9 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRMS1Q9HCU9 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRMS1Q9HCU9 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRMS1Q9HCU9 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRMS1Q9HCU9 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRMS1Q9HCU9 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRMS1Q9HCU9 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRMS1Q9HCU9 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRMS1Q9HCU9 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRMS1Q9HCU9 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRMS1Q9HCU9 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRMS1Q9HCU9 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRMS1Q9HCU9 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRMS1Q9HCU9 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRMS1Q9HCU9 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRMS1Q9HCU9 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRMS1Q9HCU9 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRMS1Q9HCU9 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRMS1Q9HCU9 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRMS1Q9HCU9 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRMS1Q9HCU9 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRMS1Q9HCU9 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRMS1Q9HCU9 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRMS1Q9HCU9 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRMS1Q9HCU9 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRMS1Q9HCU9 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRMS1Q9HCU9 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRMS1Q9HCU9 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRMS1Q9HCU9 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRMS1Q9HCU9 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRMS1Q9HCU9 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRMS1Q9HCU9 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRMS1Q9HCU9 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRMS1Q9HCU9 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
BRMS1Q9HCU9 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRMS1Q9HCU9 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
BRMS1Q9HCU9 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRMS1Q9HCU9 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRMS1Q9HCU9 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRMS1Q9HCU9 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
BRMS1Q9HCU9 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRMS1Q9HCU9 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms