Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CENPJQ9HC77 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CENPJQ9HC77 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CENPJQ9HC77 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CENPJQ9HC77 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CENPJQ9HC77 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CENPJQ9HC77 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CENPJQ9HC77 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CENPJQ9HC77 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CENPJQ9HC77 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CENPJQ9HC77 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CENPJQ9HC77 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CENPJQ9HC77 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CENPJQ9HC77 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CENPJQ9HC77 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CENPJQ9HC77 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CENPJQ9HC77 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CENPJQ9HC77 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CENPJQ9HC77 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CENPJQ9HC77 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CENPJQ9HC77 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CENPJQ9HC77 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CENPJQ9HC77 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CENPJQ9HC77 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CENPJQ9HC77 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CENPJQ9HC77 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CENPJQ9HC77 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CENPJQ9HC77 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CENPJQ9HC77 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CENPJQ9HC77 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CENPJQ9HC77 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CENPJQ9HC77 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CENPJQ9HC77 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CENPJQ9HC77 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CENPJQ9HC77 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CENPJQ9HC77 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CENPJQ9HC77 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CENPJQ9HC77 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CENPJQ9HC77 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CENPJQ9HC77 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CENPJQ9HC77 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CENPJQ9HC77 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CENPJQ9HC77 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CENPJQ9HC77 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CENPJQ9HC77 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CENPJQ9HC77 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CENPJQ9HC77 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CENPJQ9HC77 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CENPJQ9HC77 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CENPJQ9HC77 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CENPJQ9HC77 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CENPJQ9HC77 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CENPJQ9HC77 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CENPJQ9HC77 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CENPJQ9HC77 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CENPJQ9HC77 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CENPJQ9HC77 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CENPJQ9HC77 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CENPJQ9HC77 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CENPJQ9HC77 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CENPJQ9HC77 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CENPJQ9HC77 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CENPJQ9HC77 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CENPJQ9HC77 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CENPJQ9HC77 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CENPJQ9HC77 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CENPJQ9HC77 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CENPJQ9HC77 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
CENPJQ9HC77 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CENPJQ9HC77 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CENPJQ9HC77 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CENPJQ9HC77 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CENPJQ9HC77 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CENPJQ9HC77 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CENPJQ9HC77 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CENPJQ9HC77 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CENPJQ9HC77 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CENPJQ9HC77 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CENPJQ9HC77 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CENPJQ9HC77 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CENPJQ9HC77 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CENPJQ9HC77 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CENPJQ9HC77 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CENPJQ9HC77 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CENPJQ9HC77 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CENPJQ9HC77 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CENPJQ9HC77 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CENPJQ9HC77 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CENPJQ9HC77 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CENPJQ9HC77 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CENPJQ9HC77 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CENPJQ9HC77 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CENPJQ9HC77 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CENPJQ9HC77 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CENPJQ9HC77 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CENPJQ9HC77 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CENPJQ9HC77 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CENPJQ9HC77 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CENPJQ9HC77 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CENPJQ9HC77 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms