Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLR2J2Q9GZM3 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLR2J2Q9GZM3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLR2J2Q9GZM3 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLR2J2Q9GZM3 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLR2J2Q9GZM3 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLR2J2Q9GZM3 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLR2J2Q9GZM3 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLR2J2Q9GZM3 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLR2J2Q9GZM3 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLR2J2Q9GZM3 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLR2J2Q9GZM3 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLR2J2Q9GZM3 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLR2J2Q9GZM3 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLR2J2Q9GZM3 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLR2J2Q9GZM3 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLR2J2Q9GZM3 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLR2J2Q9GZM3 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR2J2Q9GZM3 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR2J2Q9GZM3 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR2J2Q9GZM3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR2J2Q9GZM3 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR2J2Q9GZM3 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR2J2Q9GZM3 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR2J2Q9GZM3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR2J2Q9GZM3 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR2J2Q9GZM3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR2J2Q9GZM3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR2J2Q9GZM3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR2J2Q9GZM3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR2J2Q9GZM3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR2J2Q9GZM3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR2J2Q9GZM3 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR2J2Q9GZM3 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR2J2Q9GZM3 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR2J2Q9GZM3 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR2J2Q9GZM3 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR2J2Q9GZM3 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR2J2Q9GZM3 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR2J2Q9GZM3 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
POLR2J2Q9GZM3 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
POLR2J2Q9GZM3 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
POLR2J2Q9GZM3 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
POLR2J2Q9GZM3 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
POLR2J2Q9GZM3 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLR2J2Q9GZM3 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLR2J2Q9GZM3 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLR2J2Q9GZM3 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLR2J2Q9GZM3 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
POLR2J2Q9GZM3 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLR2J2Q9GZM3 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLR2J2Q9GZM3 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLR2J2Q9GZM3 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLR2J2Q9GZM3 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLR2J2Q9GZM3 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLR2J2Q9GZM3 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR2J2Q9GZM3 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR2J2Q9GZM3 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR2J2Q9GZM3 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR2J2Q9GZM3 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR2J2Q9GZM3 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR2J2Q9GZM3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR2J2Q9GZM3 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR2J2Q9GZM3 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR2J2Q9GZM3 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR2J2Q9GZM3 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR2J2Q9GZM3 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR2J2Q9GZM3 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR2J2Q9GZM3 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR2J2Q9GZM3 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR2J2Q9GZM3 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR2J2Q9GZM3 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR2J2Q9GZM3 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR2J2Q9GZM3 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR2J2Q9GZM3 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR2J2Q9GZM3 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR2J2Q9GZM3 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR2J2Q9GZM3 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR2J2Q9GZM3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR2J2Q9GZM3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR2J2Q9GZM3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR2J2Q9GZM3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR2J2Q9GZM3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR2J2Q9GZM3 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR2J2Q9GZM3 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR2J2Q9GZM3 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR2J2Q9GZM3 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR2J2Q9GZM3 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR2J2Q9GZM3 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR2J2Q9GZM3 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR2J2Q9GZM3 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR2J2Q9GZM3 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR2J2Q9GZM3 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR2J2Q9GZM3 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR2J2Q9GZM3 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR2J2Q9GZM3 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR2J2Q9GZM3 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR2J2Q9GZM3 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR2J2Q9GZM3 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR2J2Q9GZM3 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms