Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CIPCQ9C0C6 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
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