Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL6

PRKD2, Serine/threonine-protein kinase D2, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD2Q9BZL6 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKD2Q9BZL6 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKD2Q9BZL6 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKD2Q9BZL6 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRKD2Q9BZL6 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRKD2Q9BZL6 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRKD2Q9BZL6 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRKD2Q9BZL6 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRKD2Q9BZL6 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRKD2Q9BZL6 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRKD2Q9BZL6 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRKD2Q9BZL6 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRKD2Q9BZL6 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRKD2Q9BZL6 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PRKD2Q9BZL6 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PRKD2Q9BZL6 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PRKD2Q9BZL6 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRKD2Q9BZL6 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRKD2Q9BZL6 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PRKD2Q9BZL6 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PRKD2Q9BZL6 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRKD2Q9BZL6 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRKD2Q9BZL6 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRKD2Q9BZL6 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PRKD2Q9BZL6 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PRKD2Q9BZL6 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRKD2Q9BZL6 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PRKD2Q9BZL6 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PRKD2Q9BZL6 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
PRKD2Q9BZL6 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PRKD2Q9BZL6 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PRKD2Q9BZL6 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PRKD2Q9BZL6 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PRKD2Q9BZL6 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PRKD2Q9BZL6 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRKD2Q9BZL6 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRKD2Q9BZL6 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRKD2Q9BZL6 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PRKD2Q9BZL6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PRKD2Q9BZL6 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PRKD2Q9BZL6 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PRKD2Q9BZL6 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRKD2Q9BZL6 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRKD2Q9BZL6 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PRKD2Q9BZL6 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PRKD2Q9BZL6 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRKD2Q9BZL6 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PRKD2Q9BZL6 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRKD2Q9BZL6 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PRKD2Q9BZL6 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PRKD2Q9BZL6 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
PRKD2Q9BZL6 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PRKD2Q9BZL6 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PRKD2Q9BZL6 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRKD2Q9BZL6 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
PRKD2Q9BZL6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRKD2Q9BZL6 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRKD2Q9BZL6 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
PRKD2Q9BZL6 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRKD2Q9BZL6 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PRKD2Q9BZL6 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PRKD2Q9BZL6 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRKD2Q9BZL6 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PRKD2Q9BZL6 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PRKD2Q9BZL6 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PRKD2Q9BZL6 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PRKD2Q9BZL6 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRKD2Q9BZL6 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PRKD2Q9BZL6 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PRKD2Q9BZL6 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRKD2Q9BZL6 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRKD2Q9BZL6 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PRKD2Q9BZL6 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRKD2Q9BZL6 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRKD2Q9BZL6 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRKD2Q9BZL6 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PRKD2Q9BZL6 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PRKD2Q9BZL6 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PRKD2Q9BZL6 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PRKD2Q9BZL6 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRKD2Q9BZL6 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRKD2Q9BZL6 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRKD2Q9BZL6 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PRKD2Q9BZL6 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRKD2Q9BZL6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRKD2Q9BZL6 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PRKD2Q9BZL6 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PRKD2Q9BZL6 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRKD2Q9BZL6 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PRKD2Q9BZL6 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PRKD2Q9BZL6 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRKD2Q9BZL6 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRKD2Q9BZL6 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRKD2Q9BZL6 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRKD2Q9BZL6 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PRKD2Q9BZL6 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRKD2Q9BZL6 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRKD2Q9BZL6 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRKD2Q9BZL6 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRKD2Q9BZL6 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms