Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZC1

CELF4, CUGBP Elav-like family member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF4Q9BZC1 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CELF4Q9BZC1 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CELF4Q9BZC1 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CELF4Q9BZC1 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CELF4Q9BZC1 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CELF4Q9BZC1 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CELF4Q9BZC1 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CELF4Q9BZC1 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CELF4Q9BZC1 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CELF4Q9BZC1 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CELF4Q9BZC1 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CELF4Q9BZC1 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CELF4Q9BZC1 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CELF4Q9BZC1 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CELF4Q9BZC1 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CELF4Q9BZC1 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CELF4Q9BZC1 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CELF4Q9BZC1 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CELF4Q9BZC1 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CELF4Q9BZC1 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CELF4Q9BZC1 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CELF4Q9BZC1 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CELF4Q9BZC1 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CELF4Q9BZC1 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CELF4Q9BZC1 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CELF4Q9BZC1 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CELF4Q9BZC1 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CELF4Q9BZC1 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CELF4Q9BZC1 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CELF4Q9BZC1 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CELF4Q9BZC1 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CELF4Q9BZC1 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CELF4Q9BZC1 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CELF4Q9BZC1 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CELF4Q9BZC1 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CELF4Q9BZC1 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CELF4Q9BZC1 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CELF4Q9BZC1 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CELF4Q9BZC1 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CELF4Q9BZC1 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CELF4Q9BZC1 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CELF4Q9BZC1 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CELF4Q9BZC1 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CELF4Q9BZC1 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CELF4Q9BZC1 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CELF4Q9BZC1 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CELF4Q9BZC1 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CELF4Q9BZC1 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CELF4Q9BZC1 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CELF4Q9BZC1 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CELF4Q9BZC1 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CELF4Q9BZC1 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CELF4Q9BZC1 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CELF4Q9BZC1 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CELF4Q9BZC1 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CELF4Q9BZC1 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CELF4Q9BZC1 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CELF4Q9BZC1 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CELF4Q9BZC1 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CELF4Q9BZC1 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CELF4Q9BZC1 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CELF4Q9BZC1 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CELF4Q9BZC1 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CELF4Q9BZC1 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CELF4Q9BZC1 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CELF4Q9BZC1 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CELF4Q9BZC1 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CELF4Q9BZC1 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CELF4Q9BZC1 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CELF4Q9BZC1 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CELF4Q9BZC1 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CELF4Q9BZC1 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CELF4Q9BZC1 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CELF4Q9BZC1 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CELF4Q9BZC1 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CELF4Q9BZC1 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CELF4Q9BZC1 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CELF4Q9BZC1 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CELF4Q9BZC1 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CELF4Q9BZC1 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CELF4Q9BZC1 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CELF4Q9BZC1 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CELF4Q9BZC1 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CELF4Q9BZC1 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CELF4Q9BZC1 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CELF4Q9BZC1 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CELF4Q9BZC1 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CELF4Q9BZC1 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CELF4Q9BZC1 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CELF4Q9BZC1 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CELF4Q9BZC1 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CELF4Q9BZC1 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CELF4Q9BZC1 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CELF4Q9BZC1 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CELF4Q9BZC1 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CELF4Q9BZC1 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CELF4Q9BZC1 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CELF4Q9BZC1 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CELF4Q9BZC1 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CELF4Q9BZC1 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.3 ms