Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ0

KRTAP9-8, Keratin-associated protein 9-8, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-8Q9BYQ0 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP9-8Q9BYQ0 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP9-8Q9BYQ0 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP9-8Q9BYQ0 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP9-8Q9BYQ0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP9-8Q9BYQ0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP9-8Q9BYQ0 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP9-8Q9BYQ0 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP9-8Q9BYQ0 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP9-8Q9BYQ0 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP9-8Q9BYQ0 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP9-8Q9BYQ0 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP9-8Q9BYQ0 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP9-8Q9BYQ0 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP9-8Q9BYQ0 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP9-8Q9BYQ0 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP9-8Q9BYQ0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP9-8Q9BYQ0 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP9-8Q9BYQ0 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP9-8Q9BYQ0 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP9-8Q9BYQ0 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP9-8Q9BYQ0 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP9-8Q9BYQ0 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP9-8Q9BYQ0 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP9-8Q9BYQ0 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP9-8Q9BYQ0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP9-8Q9BYQ0 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP9-8Q9BYQ0 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP9-8Q9BYQ0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP9-8Q9BYQ0 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP9-8Q9BYQ0 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP9-8Q9BYQ0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP9-8Q9BYQ0 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP9-8Q9BYQ0 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP9-8Q9BYQ0 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP9-8Q9BYQ0 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP9-8Q9BYQ0 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP9-8Q9BYQ0 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP9-8Q9BYQ0 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP9-8Q9BYQ0 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP9-8Q9BYQ0 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP9-8Q9BYQ0 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP9-8Q9BYQ0 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP9-8Q9BYQ0 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP9-8Q9BYQ0 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP9-8Q9BYQ0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP9-8Q9BYQ0 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP9-8Q9BYQ0 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP9-8Q9BYQ0 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP9-8Q9BYQ0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP9-8Q9BYQ0 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP9-8Q9BYQ0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP9-8Q9BYQ0 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP9-8Q9BYQ0 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP9-8Q9BYQ0 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP9-8Q9BYQ0 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP9-8Q9BYQ0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP9-8Q9BYQ0 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP9-8Q9BYQ0 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP9-8Q9BYQ0 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP9-8Q9BYQ0 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP9-8Q9BYQ0 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP9-8Q9BYQ0 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP9-8Q9BYQ0 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP9-8Q9BYQ0 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP9-8Q9BYQ0 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP9-8Q9BYQ0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP9-8Q9BYQ0 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP9-8Q9BYQ0 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP9-8Q9BYQ0 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP9-8Q9BYQ0 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP9-8Q9BYQ0 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP9-8Q9BYQ0 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP9-8Q9BYQ0 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP9-8Q9BYQ0 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP9-8Q9BYQ0 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP9-8Q9BYQ0 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP9-8Q9BYQ0 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP9-8Q9BYQ0 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP9-8Q9BYQ0 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP9-8Q9BYQ0 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP9-8Q9BYQ0 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP9-8Q9BYQ0 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP9-8Q9BYQ0 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP9-8Q9BYQ0 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP9-8Q9BYQ0 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP9-8Q9BYQ0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP9-8Q9BYQ0 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms