Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB11FIP5Q9BXF6 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB11FIP5Q9BXF6 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB11FIP5Q9BXF6 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB11FIP5Q9BXF6 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB11FIP5Q9BXF6 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB11FIP5Q9BXF6 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB11FIP5Q9BXF6 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB11FIP5Q9BXF6 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB11FIP5Q9BXF6 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB11FIP5Q9BXF6 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB11FIP5Q9BXF6 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB11FIP5Q9BXF6 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB11FIP5Q9BXF6 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB11FIP5Q9BXF6 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB11FIP5Q9BXF6 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB11FIP5Q9BXF6 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB11FIP5Q9BXF6 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB11FIP5Q9BXF6 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB11FIP5Q9BXF6 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB11FIP5Q9BXF6 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB11FIP5Q9BXF6 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB11FIP5Q9BXF6 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB11FIP5Q9BXF6 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB11FIP5Q9BXF6 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB11FIP5Q9BXF6 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB11FIP5Q9BXF6 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB11FIP5Q9BXF6 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB11FIP5Q9BXF6 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB11FIP5Q9BXF6 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB11FIP5Q9BXF6 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB11FIP5Q9BXF6 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB11FIP5Q9BXF6 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB11FIP5Q9BXF6 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB11FIP5Q9BXF6 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB11FIP5Q9BXF6 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB11FIP5Q9BXF6 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB11FIP5Q9BXF6 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB11FIP5Q9BXF6 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB11FIP5Q9BXF6 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB11FIP5Q9BXF6 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB11FIP5Q9BXF6 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB11FIP5Q9BXF6 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB11FIP5Q9BXF6 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB11FIP5Q9BXF6 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB11FIP5Q9BXF6 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB11FIP5Q9BXF6 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB11FIP5Q9BXF6 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB11FIP5Q9BXF6 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB11FIP5Q9BXF6 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB11FIP5Q9BXF6 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB11FIP5Q9BXF6 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB11FIP5Q9BXF6 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB11FIP5Q9BXF6 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB11FIP5Q9BXF6 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB11FIP5Q9BXF6 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB11FIP5Q9BXF6 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB11FIP5Q9BXF6 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB11FIP5Q9BXF6 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB11FIP5Q9BXF6 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB11FIP5Q9BXF6 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RAB11FIP5Q9BXF6 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RAB11FIP5Q9BXF6 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RAB11FIP5Q9BXF6 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RAB11FIP5Q9BXF6 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RAB11FIP5Q9BXF6 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RAB11FIP5Q9BXF6 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RAB11FIP5Q9BXF6 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RAB11FIP5Q9BXF6 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RAB11FIP5Q9BXF6 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RAB11FIP5Q9BXF6 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RAB11FIP5Q9BXF6 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RAB11FIP5Q9BXF6 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RAB11FIP5Q9BXF6 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RAB11FIP5Q9BXF6 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RAB11FIP5Q9BXF6 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RAB11FIP5Q9BXF6 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RAB11FIP5Q9BXF6 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RAB11FIP5Q9BXF6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RAB11FIP5Q9BXF6 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RAB11FIP5Q9BXF6 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RAB11FIP5Q9BXF6 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RAB11FIP5Q9BXF6 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RAB11FIP5Q9BXF6 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RAB11FIP5Q9BXF6 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RAB11FIP5Q9BXF6 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RAB11FIP5Q9BXF6 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RAB11FIP5Q9BXF6 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RAB11FIP5Q9BXF6 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RAB11FIP5Q9BXF6 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RAB11FIP5Q9BXF6 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
RAB11FIP5Q9BXF6 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RAB11FIP5Q9BXF6 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RAB11FIP5Q9BXF6 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RAB11FIP5Q9BXF6 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms