Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS4

RIOK2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK2Q9BVS4 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
RIOK2Q9BVS4 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RIOK2Q9BVS4 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RIOK2Q9BVS4 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RIOK2Q9BVS4 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RIOK2Q9BVS4 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RIOK2Q9BVS4 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RIOK2Q9BVS4 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RIOK2Q9BVS4 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RIOK2Q9BVS4 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RIOK2Q9BVS4 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RIOK2Q9BVS4 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RIOK2Q9BVS4 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RIOK2Q9BVS4 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RIOK2Q9BVS4 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RIOK2Q9BVS4 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RIOK2Q9BVS4 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RIOK2Q9BVS4 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RIOK2Q9BVS4 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RIOK2Q9BVS4 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RIOK2Q9BVS4 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RIOK2Q9BVS4 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RIOK2Q9BVS4 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RIOK2Q9BVS4 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RIOK2Q9BVS4 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RIOK2Q9BVS4 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RIOK2Q9BVS4 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RIOK2Q9BVS4 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
RIOK2Q9BVS4 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RIOK2Q9BVS4 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
RIOK2Q9BVS4 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RIOK2Q9BVS4 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RIOK2Q9BVS4 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RIOK2Q9BVS4 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RIOK2Q9BVS4 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
RIOK2Q9BVS4 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RIOK2Q9BVS4 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RIOK2Q9BVS4 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RIOK2Q9BVS4 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RIOK2Q9BVS4 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RIOK2Q9BVS4 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RIOK2Q9BVS4 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RIOK2Q9BVS4 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RIOK2Q9BVS4 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RIOK2Q9BVS4 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RIOK2Q9BVS4 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RIOK2Q9BVS4 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
RIOK2Q9BVS4 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RIOK2Q9BVS4 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
RIOK2Q9BVS4 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RIOK2Q9BVS4 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RIOK2Q9BVS4 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RIOK2Q9BVS4 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RIOK2Q9BVS4 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RIOK2Q9BVS4 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RIOK2Q9BVS4 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RIOK2Q9BVS4 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RIOK2Q9BVS4 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RIOK2Q9BVS4 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RIOK2Q9BVS4 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RIOK2Q9BVS4 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RIOK2Q9BVS4 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
RIOK2Q9BVS4 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RIOK2Q9BVS4 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RIOK2Q9BVS4 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
RIOK2Q9BVS4 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
RIOK2Q9BVS4 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RIOK2Q9BVS4 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
RIOK2Q9BVS4 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RIOK2Q9BVS4 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RIOK2Q9BVS4 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RIOK2Q9BVS4 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RIOK2Q9BVS4 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RIOK2Q9BVS4 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RIOK2Q9BVS4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RIOK2Q9BVS4 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RIOK2Q9BVS4 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RIOK2Q9BVS4 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RIOK2Q9BVS4 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20■□□□□ 0.79
RIOK2Q9BVS4 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RIOK2Q9BVS4 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RIOK2Q9BVS4 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RIOK2Q9BVS4 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RIOK2Q9BVS4 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RIOK2Q9BVS4 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RIOK2Q9BVS4 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20■□□□□ 0.79
RIOK2Q9BVS4 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20■□□□□ 0.79
RIOK2Q9BVS4 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20■□□□□ 0.79
RIOK2Q9BVS4 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20■□□□□ 0.79
RIOK2Q9BVS4 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
RIOK2Q9BVS4 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RIOK2Q9BVS4 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RIOK2Q9BVS4 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RIOK2Q9BVS4 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RIOK2Q9BVS4 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RIOK2Q9BVS4 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RIOK2Q9BVS4 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RIOK2Q9BVS4 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RIOK2Q9BVS4 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RIOK2Q9BVS4 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms