Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU20

RSG1, REM2- and Rab-like small GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSG1Q9BU20 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms