Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSI4

TINF2, TERF1-interacting nuclear factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TINF2Q9BSI4 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TINF2Q9BSI4 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TINF2Q9BSI4 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TINF2Q9BSI4 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TINF2Q9BSI4 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TINF2Q9BSI4 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TINF2Q9BSI4 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TINF2Q9BSI4 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TINF2Q9BSI4 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TINF2Q9BSI4 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TINF2Q9BSI4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TINF2Q9BSI4 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TINF2Q9BSI4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TINF2Q9BSI4 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TINF2Q9BSI4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TINF2Q9BSI4 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TINF2Q9BSI4 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TINF2Q9BSI4 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TINF2Q9BSI4 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TINF2Q9BSI4 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TINF2Q9BSI4 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TINF2Q9BSI4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TINF2Q9BSI4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TINF2Q9BSI4 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TINF2Q9BSI4 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TINF2Q9BSI4 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TINF2Q9BSI4 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TINF2Q9BSI4 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TINF2Q9BSI4 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TINF2Q9BSI4 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TINF2Q9BSI4 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TINF2Q9BSI4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TINF2Q9BSI4 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TINF2Q9BSI4 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TINF2Q9BSI4 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TINF2Q9BSI4 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TINF2Q9BSI4 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TINF2Q9BSI4 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TINF2Q9BSI4 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TINF2Q9BSI4 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TINF2Q9BSI4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TINF2Q9BSI4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TINF2Q9BSI4 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TINF2Q9BSI4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TINF2Q9BSI4 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TINF2Q9BSI4 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TINF2Q9BSI4 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TINF2Q9BSI4 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TINF2Q9BSI4 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TINF2Q9BSI4 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TINF2Q9BSI4 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TINF2Q9BSI4 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TINF2Q9BSI4 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TINF2Q9BSI4 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TINF2Q9BSI4 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TINF2Q9BSI4 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TINF2Q9BSI4 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TINF2Q9BSI4 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TINF2Q9BSI4 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TINF2Q9BSI4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TINF2Q9BSI4 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TINF2Q9BSI4 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TINF2Q9BSI4 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TINF2Q9BSI4 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TINF2Q9BSI4 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TINF2Q9BSI4 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TINF2Q9BSI4 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TINF2Q9BSI4 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TINF2Q9BSI4 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TINF2Q9BSI4 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TINF2Q9BSI4 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TINF2Q9BSI4 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TINF2Q9BSI4 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TINF2Q9BSI4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TINF2Q9BSI4 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TINF2Q9BSI4 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TINF2Q9BSI4 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TINF2Q9BSI4 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TINF2Q9BSI4 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TINF2Q9BSI4 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TINF2Q9BSI4 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TINF2Q9BSI4 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TINF2Q9BSI4 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TINF2Q9BSI4 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TINF2Q9BSI4 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TINF2Q9BSI4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TINF2Q9BSI4 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TINF2Q9BSI4 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TINF2Q9BSI4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TINF2Q9BSI4 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TINF2Q9BSI4 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TINF2Q9BSI4 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TINF2Q9BSI4 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TINF2Q9BSI4 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TINF2Q9BSI4 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TINF2Q9BSI4 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TINF2Q9BSI4 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TINF2Q9BSI4 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TINF2Q9BSI4 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TINF2Q9BSI4 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms