Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PITX2Q99697 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PITX2Q99697 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PITX2Q99697 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PITX2Q99697 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PITX2Q99697 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PITX2Q99697 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PITX2Q99697 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PITX2Q99697 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PITX2Q99697 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PITX2Q99697 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PITX2Q99697 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PITX2Q99697 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PITX2Q99697 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PITX2Q99697 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PITX2Q99697 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PITX2Q99697 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PITX2Q99697 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PITX2Q99697 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PITX2Q99697 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PITX2Q99697 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PITX2Q99697 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PITX2Q99697 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PITX2Q99697 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PITX2Q99697 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PITX2Q99697 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PITX2Q99697 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PITX2Q99697 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PITX2Q99697 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PITX2Q99697 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PITX2Q99697 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PITX2Q99697 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PITX2Q99697 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PITX2Q99697 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PITX2Q99697 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PITX2Q99697 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PITX2Q99697 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PITX2Q99697 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PITX2Q99697 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PITX2Q99697 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PITX2Q99697 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PITX2Q99697 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PITX2Q99697 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PITX2Q99697 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PITX2Q99697 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PITX2Q99697 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PITX2Q99697 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PITX2Q99697 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PITX2Q99697 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PITX2Q99697 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PITX2Q99697 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PITX2Q99697 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PITX2Q99697 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PITX2Q99697 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PITX2Q99697 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PITX2Q99697 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PITX2Q99697 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PITX2Q99697 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PITX2Q99697 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PITX2Q99697 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PITX2Q99697 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PITX2Q99697 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PITX2Q99697 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PITX2Q99697 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PITX2Q99697 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PITX2Q99697 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PITX2Q99697 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PITX2Q99697 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PITX2Q99697 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PITX2Q99697 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PITX2Q99697 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PITX2Q99697 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PITX2Q99697 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PITX2Q99697 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PITX2Q99697 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PITX2Q99697 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PITX2Q99697 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PITX2Q99697 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PITX2Q99697 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PITX2Q99697 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PITX2Q99697 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PITX2Q99697 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PITX2Q99697 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PITX2Q99697 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PITX2Q99697 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PITX2Q99697 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PITX2Q99697 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PITX2Q99697 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PITX2Q99697 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PITX2Q99697 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PITX2Q99697 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PITX2Q99697 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PITX2Q99697 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PITX2Q99697 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PITX2Q99697 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PITX2Q99697 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PITX2Q99697 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PITX2Q99697 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PITX2Q99697 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PITX2Q99697 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms