Protein–RNA interactions for Protein: Q99590

SCAF11, Protein SCAF11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF11Q99590 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SCAF11Q99590 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SCAF11Q99590 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SCAF11Q99590 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SCAF11Q99590 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
SCAF11Q99590 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SCAF11Q99590 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SCAF11Q99590 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SCAF11Q99590 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SCAF11Q99590 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
SCAF11Q99590 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SCAF11Q99590 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SCAF11Q99590 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
SCAF11Q99590 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SCAF11Q99590 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SCAF11Q99590 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SCAF11Q99590 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SCAF11Q99590 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SCAF11Q99590 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
SCAF11Q99590 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SCAF11Q99590 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
SCAF11Q99590 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SCAF11Q99590 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SCAF11Q99590 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SCAF11Q99590 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SCAF11Q99590 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SCAF11Q99590 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SCAF11Q99590 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SCAF11Q99590 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SCAF11Q99590 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SCAF11Q99590 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SCAF11Q99590 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SCAF11Q99590 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SCAF11Q99590 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SCAF11Q99590 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
SCAF11Q99590 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
SCAF11Q99590 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
SCAF11Q99590 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
SCAF11Q99590 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SCAF11Q99590 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SCAF11Q99590 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SCAF11Q99590 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SCAF11Q99590 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SCAF11Q99590 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SCAF11Q99590 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
SCAF11Q99590 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SCAF11Q99590 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SCAF11Q99590 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SCAF11Q99590 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SCAF11Q99590 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SCAF11Q99590 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SCAF11Q99590 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SCAF11Q99590 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SCAF11Q99590 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SCAF11Q99590 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SCAF11Q99590 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SCAF11Q99590 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SCAF11Q99590 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SCAF11Q99590 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SCAF11Q99590 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SCAF11Q99590 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SCAF11Q99590 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SCAF11Q99590 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SCAF11Q99590 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SCAF11Q99590 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SCAF11Q99590 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
SCAF11Q99590 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SCAF11Q99590 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
SCAF11Q99590 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SCAF11Q99590 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SCAF11Q99590 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SCAF11Q99590 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SCAF11Q99590 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SCAF11Q99590 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SCAF11Q99590 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SCAF11Q99590 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SCAF11Q99590 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SCAF11Q99590 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SCAF11Q99590 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SCAF11Q99590 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SCAF11Q99590 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SCAF11Q99590 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SCAF11Q99590 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
SCAF11Q99590 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SCAF11Q99590 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SCAF11Q99590 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SCAF11Q99590 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SCAF11Q99590 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SCAF11Q99590 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
SCAF11Q99590 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SCAF11Q99590 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SCAF11Q99590 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SCAF11Q99590 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SCAF11Q99590 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SCAF11Q99590 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SCAF11Q99590 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SCAF11Q99590 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SCAF11Q99590 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SCAF11Q99590 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SCAF11Q99590 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms