Protein–RNA interactions for Protein: Q99575

POP1, Ribonucleases P/MRP protein subunit POP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP1Q99575 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POP1Q99575 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POP1Q99575 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POP1Q99575 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POP1Q99575 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POP1Q99575 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POP1Q99575 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
POP1Q99575 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POP1Q99575 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POP1Q99575 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
POP1Q99575 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POP1Q99575 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POP1Q99575 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POP1Q99575 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POP1Q99575 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POP1Q99575 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POP1Q99575 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POP1Q99575 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POP1Q99575 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
POP1Q99575 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POP1Q99575 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POP1Q99575 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POP1Q99575 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POP1Q99575 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POP1Q99575 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
POP1Q99575 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POP1Q99575 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POP1Q99575 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POP1Q99575 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POP1Q99575 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POP1Q99575 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
POP1Q99575 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POP1Q99575 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POP1Q99575 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POP1Q99575 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POP1Q99575 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POP1Q99575 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POP1Q99575 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POP1Q99575 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POP1Q99575 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POP1Q99575 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POP1Q99575 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POP1Q99575 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POP1Q99575 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
POP1Q99575 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POP1Q99575 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POP1Q99575 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POP1Q99575 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POP1Q99575 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POP1Q99575 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POP1Q99575 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POP1Q99575 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POP1Q99575 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POP1Q99575 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POP1Q99575 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POP1Q99575 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POP1Q99575 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POP1Q99575 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POP1Q99575 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
POP1Q99575 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POP1Q99575 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POP1Q99575 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POP1Q99575 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POP1Q99575 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POP1Q99575 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POP1Q99575 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POP1Q99575 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POP1Q99575 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POP1Q99575 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POP1Q99575 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POP1Q99575 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
POP1Q99575 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POP1Q99575 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POP1Q99575 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POP1Q99575 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POP1Q99575 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POP1Q99575 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POP1Q99575 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POP1Q99575 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POP1Q99575 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POP1Q99575 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POP1Q99575 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POP1Q99575 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POP1Q99575 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POP1Q99575 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
POP1Q99575 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POP1Q99575 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
POP1Q99575 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POP1Q99575 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POP1Q99575 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POP1Q99575 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POP1Q99575 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POP1Q99575 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
POP1Q99575 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POP1Q99575 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POP1Q99575 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POP1Q99575 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POP1Q99575 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POP1Q99575 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
POP1Q99575 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms