Protein–RNA interactions for Protein: Q99442

SEC62, Translocation protein SEC62, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC62Q99442 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEC62Q99442 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEC62Q99442 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEC62Q99442 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEC62Q99442 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEC62Q99442 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEC62Q99442 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEC62Q99442 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEC62Q99442 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEC62Q99442 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEC62Q99442 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEC62Q99442 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEC62Q99442 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEC62Q99442 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEC62Q99442 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEC62Q99442 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEC62Q99442 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEC62Q99442 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEC62Q99442 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEC62Q99442 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEC62Q99442 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEC62Q99442 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEC62Q99442 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEC62Q99442 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEC62Q99442 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEC62Q99442 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEC62Q99442 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEC62Q99442 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEC62Q99442 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEC62Q99442 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEC62Q99442 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEC62Q99442 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEC62Q99442 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEC62Q99442 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEC62Q99442 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEC62Q99442 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEC62Q99442 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEC62Q99442 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEC62Q99442 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEC62Q99442 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEC62Q99442 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEC62Q99442 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEC62Q99442 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEC62Q99442 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEC62Q99442 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEC62Q99442 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEC62Q99442 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEC62Q99442 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SEC62Q99442 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEC62Q99442 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEC62Q99442 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEC62Q99442 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEC62Q99442 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEC62Q99442 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEC62Q99442 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEC62Q99442 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEC62Q99442 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEC62Q99442 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEC62Q99442 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEC62Q99442 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEC62Q99442 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEC62Q99442 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SEC62Q99442 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEC62Q99442 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEC62Q99442 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEC62Q99442 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEC62Q99442 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEC62Q99442 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEC62Q99442 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEC62Q99442 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEC62Q99442 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEC62Q99442 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEC62Q99442 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEC62Q99442 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEC62Q99442 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEC62Q99442 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEC62Q99442 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SEC62Q99442 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SEC62Q99442 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SEC62Q99442 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEC62Q99442 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEC62Q99442 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEC62Q99442 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEC62Q99442 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEC62Q99442 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SEC62Q99442 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEC62Q99442 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEC62Q99442 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SEC62Q99442 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEC62Q99442 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEC62Q99442 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEC62Q99442 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEC62Q99442 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEC62Q99442 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEC62Q99442 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEC62Q99442 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEC62Q99442 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEC62Q99442 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEC62Q99442 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEC62Q99442 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms