Protein–RNA interactions for Protein: Q96RF0

SNX18, Sorting nexin-18, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18Q96RF0 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SNX18Q96RF0 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SNX18Q96RF0 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SNX18Q96RF0 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SNX18Q96RF0 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SNX18Q96RF0 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SNX18Q96RF0 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SNX18Q96RF0 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SNX18Q96RF0 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX18Q96RF0 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX18Q96RF0 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX18Q96RF0 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX18Q96RF0 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX18Q96RF0 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX18Q96RF0 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX18Q96RF0 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX18Q96RF0 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX18Q96RF0 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX18Q96RF0 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX18Q96RF0 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX18Q96RF0 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX18Q96RF0 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX18Q96RF0 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX18Q96RF0 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX18Q96RF0 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX18Q96RF0 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms