Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q04

LMTK3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMTK3Q96Q04 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
LMTK3Q96Q04 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
LMTK3Q96Q04 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
LMTK3Q96Q04 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
LMTK3Q96Q04 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
LMTK3Q96Q04 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
LMTK3Q96Q04 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
LMTK3Q96Q04 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
LMTK3Q96Q04 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
LMTK3Q96Q04 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
LMTK3Q96Q04 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC29.27■■■□□ 2.28
LMTK3Q96Q04 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
LMTK3Q96Q04 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
LMTK3Q96Q04 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
LMTK3Q96Q04 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
LMTK3Q96Q04 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
LMTK3Q96Q04 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
LMTK3Q96Q04 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
LMTK3Q96Q04 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
LMTK3Q96Q04 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
LMTK3Q96Q04 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
LMTK3Q96Q04 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
LMTK3Q96Q04 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
LMTK3Q96Q04 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC29.26■■■□□ 2.27
LMTK3Q96Q04 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
LMTK3Q96Q04 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
LMTK3Q96Q04 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
LMTK3Q96Q04 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
LMTK3Q96Q04 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
LMTK3Q96Q04 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
LMTK3Q96Q04 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
LMTK3Q96Q04 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
LMTK3Q96Q04 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
LMTK3Q96Q04 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
LMTK3Q96Q04 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LMTK3Q96Q04 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
LMTK3Q96Q04 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
LMTK3Q96Q04 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
LMTK3Q96Q04 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
LMTK3Q96Q04 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
LMTK3Q96Q04 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
LMTK3Q96Q04 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LMTK3Q96Q04 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LMTK3Q96Q04 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LMTK3Q96Q04 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
LMTK3Q96Q04 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
LMTK3Q96Q04 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
LMTK3Q96Q04 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
LMTK3Q96Q04 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
LMTK3Q96Q04 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
LMTK3Q96Q04 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
LMTK3Q96Q04 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
LMTK3Q96Q04 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
LMTK3Q96Q04 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
LMTK3Q96Q04 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
LMTK3Q96Q04 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
LMTK3Q96Q04 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
LMTK3Q96Q04 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
LMTK3Q96Q04 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
LMTK3Q96Q04 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
LMTK3Q96Q04 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
LMTK3Q96Q04 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
LMTK3Q96Q04 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
LMTK3Q96Q04 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
LMTK3Q96Q04 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
LMTK3Q96Q04 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
LMTK3Q96Q04 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
LMTK3Q96Q04 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
LMTK3Q96Q04 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
LMTK3Q96Q04 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
LMTK3Q96Q04 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
LMTK3Q96Q04 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
LMTK3Q96Q04 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
LMTK3Q96Q04 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
LMTK3Q96Q04 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
LMTK3Q96Q04 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
LMTK3Q96Q04 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
LMTK3Q96Q04 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
LMTK3Q96Q04 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
LMTK3Q96Q04 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
LMTK3Q96Q04 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
LMTK3Q96Q04 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
LMTK3Q96Q04 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
LMTK3Q96Q04 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
LMTK3Q96Q04 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
LMTK3Q96Q04 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC29.22■■■□□ 2.27
LMTK3Q96Q04 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
LMTK3Q96Q04 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
LMTK3Q96Q04 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
LMTK3Q96Q04 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
LMTK3Q96Q04 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
LMTK3Q96Q04 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
LMTK3Q96Q04 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LMTK3Q96Q04 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
LMTK3Q96Q04 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
LMTK3Q96Q04 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
LMTK3Q96Q04 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LMTK3Q96Q04 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
LMTK3Q96Q04 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
LMTK3Q96Q04 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms