Protein–RNA interactions for Protein: Q96PX6

CCDC85A, Coiled-coil domain-containing protein 85A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85AQ96PX6 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC85AQ96PX6 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC85AQ96PX6 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC85AQ96PX6 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC85AQ96PX6 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC85AQ96PX6 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC85AQ96PX6 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC85AQ96PX6 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC85AQ96PX6 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC85AQ96PX6 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC85AQ96PX6 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC85AQ96PX6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC85AQ96PX6 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC85AQ96PX6 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC85AQ96PX6 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC85AQ96PX6 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC85AQ96PX6 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC85AQ96PX6 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC85AQ96PX6 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC85AQ96PX6 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC85AQ96PX6 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC85AQ96PX6 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC85AQ96PX6 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC85AQ96PX6 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC85AQ96PX6 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC85AQ96PX6 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC85AQ96PX6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC85AQ96PX6 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC85AQ96PX6 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC85AQ96PX6 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC85AQ96PX6 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC85AQ96PX6 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC85AQ96PX6 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC85AQ96PX6 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC85AQ96PX6 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC85AQ96PX6 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC85AQ96PX6 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC85AQ96PX6 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC85AQ96PX6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC85AQ96PX6 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC85AQ96PX6 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC85AQ96PX6 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC85AQ96PX6 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC85AQ96PX6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC85AQ96PX6 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC85AQ96PX6 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC85AQ96PX6 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC85AQ96PX6 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC85AQ96PX6 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC85AQ96PX6 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC85AQ96PX6 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC85AQ96PX6 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC85AQ96PX6 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC85AQ96PX6 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC85AQ96PX6 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC85AQ96PX6 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC85AQ96PX6 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC85AQ96PX6 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC85AQ96PX6 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC85AQ96PX6 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC85AQ96PX6 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC85AQ96PX6 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC85AQ96PX6 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC85AQ96PX6 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC85AQ96PX6 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC85AQ96PX6 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC85AQ96PX6 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC85AQ96PX6 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCDC85AQ96PX6 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCDC85AQ96PX6 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCDC85AQ96PX6 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCDC85AQ96PX6 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCDC85AQ96PX6 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC85AQ96PX6 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC85AQ96PX6 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC85AQ96PX6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC85AQ96PX6 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC85AQ96PX6 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC85AQ96PX6 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC85AQ96PX6 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC85AQ96PX6 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC85AQ96PX6 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC85AQ96PX6 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC85AQ96PX6 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC85AQ96PX6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC85AQ96PX6 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC85AQ96PX6 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC85AQ96PX6 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC85AQ96PX6 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC85AQ96PX6 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC85AQ96PX6 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC85AQ96PX6 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC85AQ96PX6 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC85AQ96PX6 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC85AQ96PX6 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC85AQ96PX6 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC85AQ96PX6 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC85AQ96PX6 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC85AQ96PX6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC85AQ96PX6 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms