Protein–RNA interactions for Protein: Q96MU7

YTHDC1, YTH domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDC1Q96MU7 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
YTHDC1Q96MU7 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
YTHDC1Q96MU7 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
YTHDC1Q96MU7 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
YTHDC1Q96MU7 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
YTHDC1Q96MU7 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
YTHDC1Q96MU7 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
YTHDC1Q96MU7 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
YTHDC1Q96MU7 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
YTHDC1Q96MU7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
YTHDC1Q96MU7 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
YTHDC1Q96MU7 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
YTHDC1Q96MU7 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
YTHDC1Q96MU7 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
YTHDC1Q96MU7 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
YTHDC1Q96MU7 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
YTHDC1Q96MU7 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
YTHDC1Q96MU7 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
YTHDC1Q96MU7 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
YTHDC1Q96MU7 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
YTHDC1Q96MU7 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
YTHDC1Q96MU7 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
YTHDC1Q96MU7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
YTHDC1Q96MU7 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
YTHDC1Q96MU7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
YTHDC1Q96MU7 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
YTHDC1Q96MU7 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
YTHDC1Q96MU7 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
YTHDC1Q96MU7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
YTHDC1Q96MU7 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
YTHDC1Q96MU7 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
YTHDC1Q96MU7 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
YTHDC1Q96MU7 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
YTHDC1Q96MU7 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
YTHDC1Q96MU7 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
YTHDC1Q96MU7 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
YTHDC1Q96MU7 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
YTHDC1Q96MU7 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
YTHDC1Q96MU7 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
YTHDC1Q96MU7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
YTHDC1Q96MU7 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
YTHDC1Q96MU7 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
YTHDC1Q96MU7 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
YTHDC1Q96MU7 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
YTHDC1Q96MU7 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
YTHDC1Q96MU7 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
YTHDC1Q96MU7 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
YTHDC1Q96MU7 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
YTHDC1Q96MU7 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
YTHDC1Q96MU7 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
YTHDC1Q96MU7 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
YTHDC1Q96MU7 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
YTHDC1Q96MU7 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
YTHDC1Q96MU7 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
YTHDC1Q96MU7 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.04
YTHDC1Q96MU7 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
YTHDC1Q96MU7 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
YTHDC1Q96MU7 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
YTHDC1Q96MU7 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
YTHDC1Q96MU7 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
YTHDC1Q96MU7 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
YTHDC1Q96MU7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
YTHDC1Q96MU7 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
YTHDC1Q96MU7 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
YTHDC1Q96MU7 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
YTHDC1Q96MU7 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
YTHDC1Q96MU7 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
YTHDC1Q96MU7 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
YTHDC1Q96MU7 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
YTHDC1Q96MU7 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
YTHDC1Q96MU7 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
YTHDC1Q96MU7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
YTHDC1Q96MU7 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
YTHDC1Q96MU7 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
YTHDC1Q96MU7 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
YTHDC1Q96MU7 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
YTHDC1Q96MU7 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
YTHDC1Q96MU7 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
YTHDC1Q96MU7 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
YTHDC1Q96MU7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
YTHDC1Q96MU7 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
YTHDC1Q96MU7 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
YTHDC1Q96MU7 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
YTHDC1Q96MU7 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
YTHDC1Q96MU7 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
YTHDC1Q96MU7 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
YTHDC1Q96MU7 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
YTHDC1Q96MU7 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
YTHDC1Q96MU7 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
YTHDC1Q96MU7 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
YTHDC1Q96MU7 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
YTHDC1Q96MU7 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
YTHDC1Q96MU7 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
YTHDC1Q96MU7 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
YTHDC1Q96MU7 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
YTHDC1Q96MU7 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
YTHDC1Q96MU7 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
YTHDC1Q96MU7 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
YTHDC1Q96MU7 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
YTHDC1Q96MU7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms