Protein–RNA interactions for Protein: Q96M42

LINC00479, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00479, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00479Q96M42 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms